معلومة

ما الذي يصنع / يكسر الروابط الهيدروجينية بين DNA و RNA أثناء النسخ؟

ما الذي يصنع / يكسر الروابط الهيدروجينية بين DNA و RNA أثناء النسخ؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

لذلك أنا أعلم أن بوليميراز الحمض النووي الريبي يحفز روابط الفوسفوديستر التي تمسك العمود الفقري للسكر لجزيء الرنا المرسال المتنامي معًا أثناء النسخ. ومع ذلك ، فأنا أقل ثقة بشأن الروابط الهيدروجينية بين القواعد النيتروجينية للحمض النووي الريبي المتشكل وخيوط الحمض النووي النموذجية.

أفترض أن الروابط الهيدروجينية نكون تتشكل ، لكنها يجب أن تكون قصيرة العمر. تم تأكيد وجودهم هنا:

ريبونوكليوتيدات تحتوي على 3 مجموعات فوسفاتية رابطة هيدروجينية من خلال عملية اقتران القاعدة التكميلية مع ديوكسي ريبونوكليوتيدات المكشوفة على الخيط غير الملفوف الذي سيتم نسخه

وممثلة في هذا GIF:

هل بوليميراز RNA مسؤول عن تكوين الروابط الهيدروجينية بين DNA و RNA؟ هل هي إذن - كما أفترض - مسؤولة أيضًا عن كسر هذه الروابط؟ هل تكسر الروابط مدفوعة بتفاعلات كيميائية أو أكثر بسبب الحركة الفيزيائية للبوليميراز على طول قالب الحمض النووي؟

يذكر هذا الموقع روابط H المؤقتة التي شكلتها holoenzyme في مواقع المروج ، لكنني لم أتمكن من العثور على مصدر حسن السمعة يناقش روابط H العابرة بين خيوط الحمض النووي.

سأكون ممتنًا إذا كان بمقدور شخص ما تقديم وصف جزيئي أوضح لما يحدث هنا. الصور / الرسوم المتحركة هي ميزة إضافية!


لن أقول حقًا إن بوليميراز الحمض النووي الريبي "يخلق" الروابط الهيدروجينية بقدر ما هو الديناميكا الحرارية التي تخلقها. عندما نتحدث عن إنزيم "يُنشئ" رابطة ، فإن ما نشير إليه عمومًا هو إنزيم يسهل التفاعل عن طريق خفض طاقة التنشيط بحيث يمكنه المضي قدمًا.

ومع ذلك ، في الرابطة الهيدروجينية بين أزواج القواعد ، ليس هناك الكثير من طاقة التنشيط للتغلب عليها. قبل التكوين ، يتحرك النيوكليوتيد في الخلية (يذوب بالماء) ، ويكون تكوين زوج قاعدي أكثر استقرارًا من حيث الطاقة من عدم الاقتران. عندما يحدث أن ينتشر الريبونوكليوتيد في اتصال مع حبلا الحمض النووي غير المزاوج ، فإن الرابطة الهيدروجينية سوف تتشكل تلقائيًا لأنها مواتية بقوة. ومع ذلك ، فإن الشيء المتعلق بالروابط الهيدروجينية هو أنها ضعيفة إلى حد ما ، لذلك هناك توازن بين التكوين والكسر. عندما ينتشر النوكليوتيدات غير المتطابقة في تلك المساحة ، فإن الرابطة الهيدروجينية ليست قوية ، وقد تكون في اتجاه غير لائق ، لذلك سوف تنتشر مرة أخرى. عندما يدخل النيوكليوتيدات الصحيحة ، تتشكل روابط الهيدروجين تلقائيًا ، وتحتفظ بها لفترة أطول ، وتوجهها بشكل صحيح. هذا يضع الفوسفات بشكل صحيح لتشكيل العمود الفقري ، والذي يسمح لـ RNA polymerase بالمضي قدمًا في صنع العمود الفقري.

بالنسبة إلى كسر روابط الهيدروجين ، فإن الطاقة المنبعثة من تكوين رابطة الفوسفوديستر هي التي تتسبب في كسر الروابط في الطرف الآخر من هجين الحمض النووي الريبي والحمض النووي. لتبسيط الأمور كثيرًا ، يشبه الأمر نوعًا ما مثل السحّاب ، حيث يتم تحريك الانتقال الأمامي لبوليميراز الحمض النووي الريبي على طول خيط الحمض النووي عن طريق تكوين رابطة الفوسفوديستر ، والتي تكسر روابط الهيدروجين في هجين الحمض النووي الريبي والحمض النووي بطريقة ميكانيكية إلى حد ما ، حيث يغادر حبلا الحمض النووي الريبي الناشئ من خلال قناة مختلفة عن التي يقوم بها الحمض النووي.

مراجع:

يكشف النموذج الهيكلي لمجمع استطالة RNA Polymerase II مع فقاعة نسخ كاملة عن طريق دخول NTP

استطالة النسخ: تتبع غير متجانس لبوليميراز الحمض النووي الريبي وآثاره البيولوجية


على الرغم من أن الإجابة التي قدمهاStephenB صحيحة بشكل أساسي ، إلا أنني أود أن أكمل هذا بمزيد من الرسوم التوضيحية المرئية - بما في ذلك رابط إلى الرسوم المتحركة التي طلبها الملصق - بالإضافة إلى تكرار النقاط المهمة التي طرحها حول الإنزيمات. هذا سؤال حول علم الإنزيمات والبيولوجيا الهيكلية وهو في الأساس مادة كيميائية بطبيعتها.

الانزيمات والكيمياء

للإجابة على السؤال المحدد المطروح:

رقم الانزيمات ليس مسئول عن خلق أي نوع من السندات.

إن تكوين الروابط - بما في ذلك الروابط الهيدروجينية للأزواج القاعدية - تحكمه الديناميكا الحرارية. الإنزيمات هي محفزات وتؤثر فقط على سرعة التفاعلات المواتية للديناميكا الحرارية. باختصار:

1. ردود الفعل تحدث فقط مما يؤدي إلى انخفاض في طاقة جيبس ​​الحرة.
نحن نقارن دائمًا بين موقفين بديلين. في حالة تهجين الحمض النووي ، على سبيل المثال ، قد نضطر في مراحل مختلفة من النسخ إلى التفكير في ssDNA الخامس. dsDNA و ssDNA و ssRNA الخامس. مضاعف الحمض النووي الريبي DNA ، الحمض النووي المتماثل الحمض النووي DNA الخامس. مضاعفات الحمض النووي الريبي الحمض النووي. لا تكمن مشكلة النسخ في سبب ارتباط rNTPs بالحمض النووي ، ولكن لماذا تحدث الهياكل المختلفة المرتبطة بالهيدروجين ، بالضرورة ، في مراحل مختلفة من الدورة.

2. ردود الفعل تنطوي على توازن بين الاتجاهين الأمامي والخلفي.
ما لم تتم إزالة منتج التفاعل ، لا توجد بشكل عام صعوبة مفاهيمية حول التفاعل الذي يحدث أيضًا في الاتجاه العكسي. يعتمد مدى حدوث ذلك على موضع التوازن. بالنسبة للنسخ ، يعد هذا الانعكاس مهمًا لأن امتدادات الحمض النووي الريبي ، التي كانت مرتبطة في البداية بالهيدروجين بالحمض النووي ، تحتاج إلى التحرر منه ، ويجب أن تتناوب امتدادات الحمض النووي بين كونها مزدوجة الشريطة وحيدة الجديلة.

3. تسرع الإنزيمات التفاعلات (في الاتجاهين الأمامي والخلفي). ليس لديهم أي تأثير على ما إذا كان التفاعل مواتًا للديناميكا الحرارية أم لا.
كما ذكرStephenB ، تعمل الإنزيمات على تسريع التفاعلات من خلال التأثير على طاقة التنشيط - بشكل عام رفع الحالة الأرضية أو خفض طاقة التنشيط من خلال تسهيل تسلسل تفاعل بديل. في حالة ارتباط rNTP ، نعلم من الكيمياء أن قوة الرابطة الهيدروجينية تعتمد على اتجاهها. ومن ثم فإن العديد من الاصطدامات العشوائية ستكون غير منتجة. بدون معرفة أي شيء عن الوضع الحقيقي ، يمكننا التكهن بأن الروابط الضعيفة بالبقايا الموجودة على موقع ربط rNTP لبوليميراز الحمض النووي الريبي قد تسهل إعادة التوجيه إلى الموضع الأمثل لإقران القاعدة.

تمت تغطية هذه المادة بشكل كامل في كتب الكيمياء الحيوية ، على سبيل المثال بيرج وآخرون. الفصل 8.

النسخ - الفيلم

في وجهات نظر الخلية في عام 2012 ، وصف Cheung and Cramer فيلمًا عن نسخ mRNA بواسطة RNA polymerase II وعوامل أخرى تستند إلى الهياكل المنشورة لمختلف الوسائط. على الرغم من أن هذا تم إنتاجه عن طريق الاستيفاء بين "اللقطات" الثابتة للبنى ، إلا أنها محاولة شاملة باستخدام هياكل ثلاثية الأبعاد لمعالجة مراحل مختلفة من النسخ - ذوبان dsDNA ، والحركة بالنسبة إلى ازدواج الحمض النووي DNA ، وتفكك مضاعف مضاعف عابر. هذا موضح في شكل من الورق:

لقد قمت بإنشاء مركب خاص بي من لقطات الشاشة لهذا القسم من الفيلم (من حوالي 3.00 دقائق) والذي يتعامل مع ربط rNTPs. على عكس الشكل أعلاه ، فإنه يُظهر جزءًا صغيرًا فقط من بوليميريز الحمض النووي الريبي من أجل التركيز على التغييرات الديناميكية التي تحدث في قسمين من هذا البروتين عند ربط الركيزة (ميزة أخرى للعديد من الإنزيمات).

خطوة ربط rNTP

يتم تلخيص تصوير ربط rNTP في الفيلم على النحو التالي:

… ترتبط ركيزة NTP أولاً بتكوين مركز نشط مفتوح ، وتعتمد حالة ما قبل الإدراج…. ثم يتحرك NTP قليلاً ليحتل موقع الإدراج حيث تطوي حلقة الزناد لإغلاق المركز النشط…. يؤدي إغلاق الموقع النشط حول NTP إلى إنشاء جهات اتصال مطلوبة لاختيار NTP الصحيح ويؤدي إلى دمج النوكليوتيدات التحفيزية وتمديد RNA….

هذا على أساس عمل فاسيلييف وآخرون. الذي يصف التفاعلات الجزيئية بمزيد من التفصيل. أقتبس مقتطفًا من ورقتهم لتوضيح أن الافتراض حول تفاعل الركيزة مع البقايا على الإنزيم قد تم إثباته ، ولكن أيضًا أن تعقيد التفاعلات لا يمكن تقديم ملخص بسيط:

في مجمع ttEC / AMPcPP ، تشكل AMPcPP زوجًا أساسيًا من Watson-Crick مع قالب المستقبل المحصور بين نهاية 39 من هجين RNA / DNA على جانب واحد وبقايا البروتين من TH و BH على الجانب الآخر. يبدو أن التقاء b91238 (TH) و Thr b91088 (BH) ، اللذان يتراكمان مباشرة على أساس الركيزة والقالب ، على التوالي ، ضروريان لتحديد موضع واختيار الركيزة (الشكل 2) ؛ يبدو أن بقايا RNAPII المقابلة Leu 1081 و Thr 831 لها وظائف مماثلة في الخميرة EC13. بالاتفاق مع دراسات النمذجة والكيمياء الحيوية 1 ، 4 ، 15 ، يشكل Asn b9737 روابط هيدروجينية مع كل من O39 و O29 من ريبوز الركيزة ، مما يسمح بالتمييز ضد dNTPs غير المشابه التي تفتقر إلى أي من هذه الذرات أو كليهما (الشكل 2 ب ، ج) .

سيحتاج القارئ المهتم إلى دراسة الورقة بنفسه. أقصر نفسي على تذكيره بأن هياكل الإنزيمات ديناميكية لأنه قد يكون هناك توازن بين الهياكل المحتملة المختلفة ويمكن تغيير موضع هذا التوازن من خلال ربط الجزيئات الأخرى بالإنزيم. لا تزال كيمياء - وليس سحر!

كودا - لماذا لا توجد إجابة مباشرة؟

قد يتساءل القارئ الذي اعتاد على وجود آليات تفاعل للإنزيمات معروضة في شكل عقائدي ، عن سبب وجود الكثير من الشروط والأحكام والديناميكيات الجزيئية المشاركة في العمل على كيفية وصول rNTP إلى الشكل الصحيح للارتباط بقالب الحمض النووي. الإجابة هي أنه على الرغم من أن بنية موقع الربط (في الواقع يبدو أن هناك بديلين) معروفة بالتفصيل ، فإن المواضع المتتالية لـ rNTP ليست كذلك ، لأنه لا توجد طريقة "لتجميدها" في هذه المراحل المختلفة. بشكل عام ، يلتقط المرء المواد الوسيطة في التفاعل عن طريق صنع مشتقات منها ترتبط ولكنها لا تتفاعل ، على سبيل المثال. لذلك من السهل نسبيًا الحصول على هياكل لربط rNTP والمرتبطة بالهيدروجين ، ولكن ليس في طريقها. تشير ورقة بحثية نُشرت عام 2017 في مجلة Journal of Biophysics إلى أن الأساليب الرياضية لا تزال تُستخدم كأساس للحجج حول آلية الربط التفصيلية .


النسخ (علم الأحياء)

النسخ هي عملية نسخ جزء من الحمض النووي إلى الحمض النووي الريبي. يقال إن أجزاء الحمض النووي المنسوخة إلى جزيئات الحمض النووي الريبي التي يمكنها تشفير البروتينات تنتج الحمض النووي الريبي المرسال (مرنا). يتم نسخ أجزاء أخرى من DNA إلى جزيئات RNA تسمى RNAs غير المشفرة (ncRNAs). متوسط ​​على أنواع خلايا متعددة في نسيج معين ، كمية الرنا المرسال هي أكثر من 10 أضعاف كمية الرنا الريباسي (على الرغم من أن أنواع الخلايا المفردة قد تتجاوز الرنا المرسال). [1] الغالبية العامة للـ mRNA في الخلايا صالحة على الرغم من أنه يمكن نسخ أقل من 2٪ من الجينوم البشري إلى mRNA (الجينوم البشري # الترميز مقابل الحمض النووي غير المشفر) ، في حين أن 80٪ على الأقل من الحمض النووي الجيني للثدييات يمكن أن يكون نشطًا نسخ (في نوع واحد أو أكثر من الخلايا) ، مع اعتبار غالبية 80 ٪ من هذه الخلايا ncRNA. [2]

كل من DNA و RNA عبارة عن أحماض نووية تستخدم أزواج قاعدية من النيوكليوتيدات كلغة تكميلية. أثناء النسخ ، تتم قراءة تسلسل الحمض النووي بواسطة بوليميراز الحمض النووي الريبي ، والذي ينتج خيطًا مكملًا مضادًا للتوازي من الحمض النووي الريبي يسمى النسخة الأولية.

تتم عملية النسخ في الخطوات العامة التالية:

  1. إن بوليميراز الحمض النووي الريبي ، مع واحد أو أكثر من عوامل النسخ العامة ، يرتبط بالحمض النووي المحفز.
  2. يولد بوليميراز الحمض النووي الريبي فقاعة نسخ تفصل بين خيوط حلزون الحمض النووي. يتم ذلك عن طريق كسر الروابط الهيدروجينية بين نيوكليوتيدات الحمض النووي التكميلية.
  3. يضيف RNA polymerase نيوكليوتيدات RNA (وهي مكملة للنيوكليوتيدات في خيط DNA واحد).
  4. يتكون العمود الفقري للسكر والفوسفات من الحمض النووي الريبي بمساعدة من بوليميراز الحمض النووي الريبي لتشكيل حبلا الحمض النووي الريبي.
  5. تنكسر الروابط الهيدروجينية في لولب الحمض النووي الريبي والحمض النووي ، وتحرر حبلا الحمض النووي الريبي المركب حديثًا.
  6. إذا كانت الخلية تحتوي على نواة ، فقد تتم معالجة الحمض النووي الريبي بشكل أكبر. قد يشمل ذلك عديد الأدينيل ، والسد ، والربط.
  7. قد يبقى الحمض النووي الريبي في النواة أو يخرج إلى السيتوبلازم من خلال مجمع المسام النووي.

إذا تم نسخ امتداد الحمض النووي إلى جزيء RNA الذي يشفر البروتين ، فإن الحمض النووي الريبي يسمى messenger RNA (mRNA) ، ويعمل mRNA بدوره كقالب لتخليق البروتين من خلال الترجمة. يمكن نسخ امتدادات أخرى من الحمض النووي إلى RNAs صغيرة غير مشفرة مثل microRNA ، نقل RNA (tRNA) ، RNA صغير نووي (snoRNA) ، RNA نووي صغير (snRNA) ، أو جزيئات RNA إنزيمية تسمى الريبوزيمات [3] وكذلك أكبر الحمض النووي الريبي غير المشفر مثل الحمض النووي الريبي (الرنا الريباسي) والحمض النووي الريبي الطويل غير المشفر (lncRNA). بشكل عام ، يساعد الحمض النووي الريبي في تصنيع البروتينات وتنظيمها ومعالجتها ، وبالتالي يلعب دورًا أساسيًا في أداء الوظائف داخل الخلية.

في علم الفيروسات ، يمكن أيضًا استخدام مصطلح النسخ عند الإشارة إلى تخليق الرنا المرسال من جزيء الحمض النووي الريبي (أي ما يعادل تكرار الحمض النووي الريبي). على سبيل المثال ، قد يكون جينوم الحمض النووي الريبي أحادي الجديلة (ssRNA -) ذو المعنى السلبي نموذجًا للـ RNA أحادي الجديلة إيجابي الإحساس (ssRNA +) [ التوضيح المطلوب ]. هذا لأن خيط الحس الإيجابي يحتوي على معلومات التسلسل اللازمة لترجمة البروتينات الفيروسية اللازمة للتكاثر الفيروسي. يتم تحفيز هذه العملية بواسطة نسخة متماثلة من الحمض النووي الريبي الفيروسي. [4] [ التوضيح المطلوب ]


02 البيولوجيا الجزيئية

تسرد هذه الصفحة المفاهيم والمهارات المتوقعة للموضوع الثاني.
مفيد للمراجعة.
يمكن العثور على ملاحظات المراجعة التفصيلية والأنشطة والأسئلة في كل صفحة من صفحات الموضوعات الفرعية.

  • 2.1 الجزيئات في عملية التمثيل الغذائي .2
  • 2.2 الماء
  • 2.3 الكربوهيدرات والدهون
  • 2.4 البروتينات
  • 2.5 إنزيمات
  • 2.6 هيكل الحمض النووي والحمض النووي الريبي
  • 2.7 استنساخ الحمض النووي والنسخ والترجمة
  • 2.8 تنفس الخلية
  • 2.9 التمثيل الضوئي

2.1 الجزيئات لعملية التمثيل الغذائي

  • يشرح علم الأحياء الجزيئي العمليات البيولوجية من حيث المواد الكيميائية المعنية.
  • مجموعة متنوعة من المركبات القائمة على الكربون في الكائنات الحية لأن ذرات الكربون يمكن أن تشكل أربعة روابط تساهمية.
    على سبيل المثال الكربوهيدرات والدهون والبروتينات والأحماض النووية.
  • تشكل جميع التفاعلات المحفزة بالإنزيم في الخلية عملية التمثيل الغذائي. هناك نوعان:
    • الابتنائية: تكوين جزيئات ضخمة من المونومرات بالتكثيف.
    • الهدم: تقسيم الجزيئات المعقدة إلى جزيئات أبسط عن طريق التحلل المائي.
    • ارسم مخططات لـ:
      • & alphaD-glucose & amp & betaD-glucose،
      • D- ريبوز ،
      • حمض دهني
      • حمض أميني مع مجموعة R معممة.
      • السكريات الأحادية
      • السكريات ،
      • الدهون (الدهون الثلاثية ، الفوسفوليبيد والمنشطات)
      • أحماض أمينية
      • روابط الببتيد والببتيد.

      2.2 الماء

      • تتشكل الروابط الهيدروجينية بين جزيئات الماء القطبية.
      • هذه القوة تعطي الماء خصائص خاصة ، على سبيل المثال التماسك ، الالتصاق ، الحراري
        وخصائص المذيبات.
      • الجلوكوز والأحماض الأمينية والأملاح محبة للماء بينما الكوليسترول والدهون كارهة للماء.
      • قارن الخصائص الحرارية للماء بخصائص الميثان واشرح كيف يؤثر ذلك على استخدامه كمبرد في العرق.
      • قارن قابلية ذوبان الجلوكوز والأحماض الأمينية والكوليسترول والدهون والأكسجين وكلوريد الصوديوم في الماء واربط ذلك بطريقة نقلهم.
      • اشرح فوائد خصائص الماء للكائنات الحية (الشفافية والكثافة غير مطلوبة.)
      • قيم مدى أهمية الترابط الهيدروجيني في خواص الماء

      2.3 الكربوهيدرات والدهون

      • تربط تفاعلات التكثيف مونومرات السكاريد الأحادي معًا
        السكريات الثنائية الشكل (السكروز واللاكتوز والمالتوز) والسكريات (نشا السليلوز والجليكوجين)
      • يمكن أن تكون الأحماض الدهنية مشبعة أو أحادية غير مشبعة أو متعددة غير مشبعة.
        ورابطة الدول المستقلة أو الأيزومرات العابرة إذا كانت غير مشبعة. (أسماء الجزيئات غير مطلوبة)
      • يمكن لثلاثة أحماض دهنية وجزيئات جلسرين واحدة أن تشكل دهونًا ثلاثية عن طريق تفاعلات التكثيف.
      • كيف ترتبط بنية السليلوز والنشا (أميلوز وأميلوبكتين) في النباتات والجليكوجين في البشر بالوظيفة.
      • لتخزين الطاقة على المدى الطويل لدى البشر
        الدهون أفضل من الكربوهيدرات.
      • تم تعديل البطاطس وراثيا لتقليل مستوى الأميلوز إلى
        تنتج مادة لاصقة أكثر فعالية.
      • تقييم الأدلة المتضاربة بشأن المخاطر الصحية للدهون غير المشبعة والأحماض الدهنية المشبعة وتقييم الأساليب المستخدمة
      • Abiliy لاستخدام برامج التصور الجزيئي مثل jmol لمقارنة السليلوز والنشا والجليكوجين.
      • القدرة على حساب مؤشر كتلة الجسم باستخدام مخطط رمزي أو عن طريق الحساب

      2.4 البروتينات

      • ترتبط الأحماض الأمينية ببعضها البعض عن طريق تفاعلات التكثيف لتشكيل ثنائي الببتيدات وعديد الببتيدات.
      • ترمز الجينات وخيوط الرنا المرسال إلى 20 نوعًا من الأحماض الأمينية المختلفة التي تم دمجها في عديد الببتيدات على الريبوسومات.
      • يمكن ربط الأحماض الأمينية معًا بأي تسلسل (مشفر بواسطة الجينات) مما يعطي نطاقًا كبيرًا من عديد الببتيدات الممكنة.
      • قد يكون البروتين عبارة عن عديد ببتيد واحد أو أكثر من عديد ببتيد واحد متصل معًا.
      • يتم تحديد الشكل ثلاثي الأبعاد للبروتين من خلال تسلسل الأحماض الأمينية.
      • تقوم الكائنات الحية بتجميع العديد من البروتينات المختلفة مع مجموعة واسعة من الوظائف (وليس البنية)
        على سبيل المثال روبيسكو ، الأنسولين ، الغلوبولين المناعي ، رودوبسين ، الكولاجين وحرير العنكبوت.
      • كل فرد لديه بروتين فريد.
      • علم البروتينات وإنتاج البروتينات بواسطة الخلايا المزروعة في المخمرات
        تقدم العديد من الفرص للصناعات الغذائية والصيدلانية وغيرها
        (استخدام)

      2.5 إنزيمات

      • دور الموقع النشط حيث ترتبط ركائز معينة.
      • تأثير حركة الجزيئات واصطدام الركائز بالموقع النشط.
      • تأثير درجة الحرارة ودرجة الحموضة وتركيز الركيزة على معدل نشاط الإنزيمات. (بما في ذلك تغيير الطبيعة)
      • تستخدم الإنزيمات (غالبًا ما تكون مجمدة) على نطاق واسع في الصناعة لإنتاج عناصر بما في ذلك الحليب الخالي من اللاكتوز وعصير الفاكهة ومسحوق الغسيل.
      • مزايا الحليب الخالي من اللاتوز ، وطرق إنتاجه ، بما في ذلك التثبيت في حبيبات الألجينات.
      • معرفة التصاميم الممكنة للتجارب لاختبار تأثير درجة الحرارة ودرجة الحموضة وتركيز الركيزة على نشاط الإنزيم.
      • عملي 3: التحقيق في عامل يؤثر على نشاط الانزيم.
      • مهارة رسم رسم بياني للنتائج المتوقعة في تجارب الإنزيمات والقدرة على شرح أسباب أشكالها.

      2.6 هيكل الحمض النووي والحمض النووي الريبي

      • DNA و RNA عبارة عن بوليمرات يتكون كل منها من النيوكليوتيدات.
      • يتكون نيوكليوتيد الحمض النووي من قواعد الفوسفات و deoxyribose (سكر البنتوز) والنيوكليوتيدات (T ، A ، G ، C)
      • تتكون نيوكليوتيدات الحمض النووي الريبي من الفوسفات والريبوز (سكر البنتوز) وقواعد النوكليوتيدات (U ، A ، G ، C)
      • الاقتران الأساسي هو & quot؛ مكمل & quot
      • الحمض النووي هو عبارة عن حلزون مزدوج مكون من خيطين من النيوكليوتيدات مرتبطين بواسطة رابطة الهيدروجين الحمض النووي الريبي هو خيط واحد من النيوكليوتيدات.
      • يجب أن يكون الطلاب قادرين على رسم مخططات بسيطة لنيوكليوتيدات الحمض النووي الريبي (DNA) والحمض النووي الريبي (RNA) - باستخدام أشكال بسيطة (وليس الرموز الكيميائية)
      • يجب أن يتعلم الطلاب رسم خيطين متعارضين من الحمض النووي يظهران الاقتران الأساسي ، بنية A & # 39ladder & # 39 كافية ، وتفاصيل البيورينات / بيريميدين غير مطلوبة

      2.7 نسخ الحمض النووي

      • تكرار الحمض النووي
      • يؤدي الاقتران القاعدي التكميلي إلى تكرار شبه محافظ للحمض النووي.
      • يزيل إنزيم الهليكس اللولب المزدوج ويفكك روابط الهيدروجين التي تربط شريطي الحمض النووي معًا.
      • يربط بوليميراز الدنا (اسم عام) نيوكليوتيدات الدنا معًا لتشكيل جديلة دنا جديدة ، باستخدام الخيط الموجود مسبقًا كقالب.
      • النسخ هو توليف mRNA بواسطة RNA polymerase باستخدام تسلسل قاعدة DNA كقالب
      • الترجمة هي تخليق عديد الببتيدات على الريبوسومات.
      • يتم تحديد تسلسل الأحماض الأمينية لعديد الببتيدات بواسطة mRNA وفقًا للشفرة الجينية.
      • ثلاث قواعد من الرنا المرسال تسمى كودون وتتوافق مع حمض أميني واحد في عديد الببتيد.
      • تعتمد الترجمة على الاقتران الأساسي التكميلي بين الكودونات على mRNA و anticodons على tRNA.
      • الوعي بأنه في تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) ينتج إنزيمات تسمى بوليميراز DNA Taq نسخًا متعددة من الحمض النووي.
      • القدرة على شرح كيفية دعم نتائج Meselson و Stahl & rsquos لنظرية النسخ شبه المحافظ للحمض النووي.
      • معرفة أن الأنسولين البشري يمكن إنتاجه في البكتيريا بسبب التعدد & quot العالمي & quot في الشفرة الوراثية. هذا يسمح للجينات بالانتقال بين الأنواع.
      • القدرة على استخدام جدول الكود الجيني لاستنتاج الكود (الكودون) الذي يتوافق مع أي حمض أميني واستنتاج تسلسل الأحماض الأمينية المشفرة بواسطة mRNA قصير أو تسلسل قاعدة الحمض النووي لخيط mRNA معين

      2.8 التنفس

      • تعريف التنفس الخلوي ، & quotthe الإطلاق المتحكم فيه للطاقة من المركبات العضوية لإنتاج ATP & quot
      • ينتج ATP مصدر طاقة جاهز للاستخدام الفوري في الخلية.
      • يعطي تنفس الخلايا اللاهوائية عائدًا صغيرًا من ATP من الجلوكوز مقارنة بالتنفس الهوائي الذي يكون إنتاجه كبيرًا.
      • يتطلب تنفس الخلايا الهوائية أيضًا الأكسجين.
      • يجب معرفة الركائز (مثل الجلوكوز) والنفايات النهائية (مثل الماء وثاني أكسيد الكربون واللاكتات والإيثانول).
      • يستخدم التنفس الخلوي اللاهوائي في الخمائر لإنتاج الإيثانول وثاني أكسيد الكربون في الخبز.
      • يستخدم التنفس اللاهوائي في جسم الإنسان لزيادة قوة تقلصات العضلات وينتج اللاكتات.
      • تعرف على كيفية استخدام أجهزة قياس التنفس البسيطة لقياس معدل التنفس.
      • لمعرفة أن القلويات تستخدم لامتصاص ثاني أكسيد الكربون2 يتم إنتاجه في أجهزة قياس التنفس ، بحيث يكون الانخفاض في حجم الغاز بسبب استخدام الأكسجين.
      • للحفاظ على درجة الحرارة ثابتة ، بحيث لا تتغير أحجام الغاز من خلال تمدد / تقلص الغاز.

      2.9 التمثيل الضوئي

      • يستخدم التمثيل الضوئي الطاقة الضوئية لإنتاج مركبات الكربون في الخلايا.
      • يتراوح الضوء المرئي من البنفسجي (400 نانومتر) وهو أقصر طول موجي إلى الأحمر (700 نانومتر) الأطول.
        (لا يتوقع من الطلاب أن يتذكروا الأطوال الموجية للألوان الأخرى.)
      • يظهر طيف الامتصاص - الضوء الأحمر والأزرق يمتص معظم الضوء الأخضر أقل (ينعكس).
      • التحلل الضوئي للماء ينتج الأكسجين
        (وكذلك ATP & amp NADPH)
      • الطاقة (من التحلل الضوئي) ضرورية لإنتاج الكربوهيدرات ومركبات الكربون الأخرى من ثاني أكسيد الكربون.
      • يمكن أن تكون العوامل المحددة لعملية التمثيل الضوئي هي درجة الحرارة وشدة الضوء وتركيز ثاني أكسيد الكربون.
      • افهم أن التمثيل الضوئي قد تسبب في حدوث تغييرات في الغلاف الجوي للأرض و rsquos والمحيطات وترسب الصخور.
      • تعلم كيفية الرسم
        • طيف امتصاص للكلوروفيل و
        • طيف عمل لعملية التمثيل الضوئي.

        الجزيئات لعملية التمثيل الغذائي 2.1

        يمكن تفسير بنية الكائنات الحية جزئيًا بواسطة الجزيئات التي تتكون منها. يعتمد العيش على الكربون لأن الطريقة التي تشكل بها ذرات الكربون روابط تساهمية أساسية في بنية الجزيئات التي تتكون منها الكائنات الحية.

        الماء 2.2

        في هذا القسم سوف تتعلم كل شيء عن الماء ، عن تكوينه ، قطبية ، روابط الهيدروجين وما الذي يجعل الماء فريدًا جدًا من حيث خصائصه الفيزيائية.

        الكربوهيدرات والدهون 2.3

        هذا موضوع حول ثلاثة أنواع من الكربوهيدرات ، السكريات الأحادية ، السكريات الثنائية والسكريات وكذلك الدهون مثل الدهون الثلاثية التي تشكل العديد من الزيوت في جسم الإنسان. يتضمن تحليل أشكال الجزيئات ووظائفها.

        البروتينات 2.4

        هذا الموضوع هو كل شيء عن البروتينات التي هي أكثر الجزيئات تنوعًا. إنها مبنية من عشرين نوعًا من الأحماض الأمينية فقط وتظهر مجموعة كبيرة ومتنوعة من الأشكال ، من حرير العنكبوت إلى هرمونات الأنسولين.

        الإنزيمات 2.5

        تتحكم الإنزيمات تقريبًا في كل شيء يحدث داخل خلايا جميع الكائنات الحية. في هذا الموضوع ننظر في كيفية عمل الإنزيمات للتفاعلات بشكل أسرع وكذلك تأثير العوامل البيئية المختلفة على معدل التفاعلات التي يتحكم فيها الإنزيم.

        هيكل الحمض النووي والحمض النووي الريبي 2.6

        في هذا الموضوع ، يلزم معرفة بنية النيوكليوتيدات للحمض النووي الريبي النووي والحمض النووي الريبي ، كما هو الحال مع الفهم البسيط لهيكل اللولب المزدوج والحلزون المزدوج الذي تقطعت به السبل.

        استنساخ الحمض النووي والنسخ والترجمة 2.7

        يبحث هذا الموضوع في هذه الأساليب ، استنساخ الحمض النووي الذي يصنع نسخة طبق الأصل من المادة الجينية بالإضافة إلى النسخ والترجمة في التعبير عن الجين لصنع بروتين.

        التنفس 2.8

        يغطي هذا الموضوع أساسيات التنفس الهوائي واللاهوائي. من المهم معرفة دور ATP في الخلايا وأيضًا أن يكون لديك خبرة في استخدام مقياس التنفس لقياس معدل التنفس.

        البناء الضوئي 2.9

        تم تقديم التمثيل الضوئي في هذا الموضوع. الفكرة الرئيسية الجديدة هي أن العملية ليست تفاعل خطوة واحدة ولكنها سلسلة من التفاعلات التي تحدث في أجزاء مختلفة من البلاستيدات الخضراء.


        تقرير الممتحنين

        تم الرد على هذا بشكل جيد بشكل عام حيث كان معظم المرشحين قادرين على إعطاء ما يكفي من الميزات المهمة لعمل الإنزيم لتحقيق نتائج جيدة. كان أحد الأخطاء التي شوهدت في عدد من الردود هو القول بأن الموقع النشط موجود على الركيزة وليس على الإنزيم.

        لم يجد المرشحون المطلعون صعوبة في تسجيل العلامات الكاملة من خلال إعطاء وصف دقيق لدور الإنزيمات في تكرار الحمض النووي. لم يكن من الضروري التركيز على الخيوط الرائدة والمتأخرة لأن عمل الإنزيمات المختلفة هو نفسه إلى حد كبير ، على الرغم من أنه بالطبع يتم إضافة المواد الأولية بشكل متكرر إلى الخيط المتأخر ثم استبدالها. من الواضح أن بعض المرشحين كانوا قلقين من أنه تم سؤالهم عن تكرار الحمض النووي بدائيات النواة. هذا بالطبع هو نوع تكرار الحمض النووي الذي حدده البرنامج وكان لسنوات عديدة. يجدر التأكد من أن المرشحين يعرفون أنهم تعلموا عن هذا بدلاً من تكرار حقيقيات النوى.

        تمت الإجابة على هذا الجزء بشكل جيد للغاية حيث حصل العديد من المرشحين على درجات كاملة. كانت هناك بعض الأخطاء في التدوين بأحرف مختلفة من الأبجدية المستخدمة للأليلات من نفس الجين أو الكروموسومات X و Y مما يشير إلى الخلط بين الجينات الجسدية والجنس المرتبطة بالجنس.


        مراجعة تقييم الهدف الثاني Biochem

        الهيكل الرباعي - يحتوي البروتين على أكثر من سلسلة بولي ببتيد واحدة.

        تفاعل كيميائي - - يمتص ويطلق الطاقة - تنشيط الطاقة - يتم إطلاق الطاقة (الحرارة وضوء الأمبامب) عند كسر الروابط.

        تفاعل طارد للحرارة - Exo = لإطلاق Thermo = تفاعل كيميائي - حراري يطلق طاقة أكثر مما يمتص (مثل الحرارة وضوء الأمبامب)

        مثال على تفاعل طارد للحرارة - التنفس الخلوي: يكسر الجلوكوز لإنتاج الطاقة الخلوية

        تفاعل ماص للحرارة - إندو = امتصاص الترمس = الحرارة - يمتص طاقة أكثر مما يطلقه

        مثال على تفاعل ماص للحرارة - التمثيل الضوئي - يأخذ الضوء ليتحلل لتكوين الجلوكوز

        محفز - مادة تقلل من طاقة التنشيط اللازمة لبدء تفاعل كيميائي

        الإنزيمات - المحفزات التي تستخدمها الخلايا - تزيد من معدل التفاعل الكيميائي - خاصة بالركائز

        بنية الإنزيم - - هي بروتينات - تلتف ، تطوي ، تنحني إلى الشكل النهائي - الشكل يجذب جزيئات معينة

        الركيزة - الجزيئات التي ترتبط بالإنزيم

        الموقع النشط - - الموقع على الإنزيم حيث ترتبط الركيزة

        وظيفة بوليميراز الحمض النووي في عملية PCR. - - زيادة التعبير -2 الجينات - SIRT1 و ampamp SIRT

        وظيفة الجزيء - المكون الهيكلي للطبقة الدهنية الثنائية

        كيف يمكن أن يتغير إنتاج الدهون في الخلية من أجل الحفاظ على سيولة غشاء الخلية حيث تتكيف مع درجات الحرارة المنخفضة؟ - إنتاج دهون ذات سلاسل أحماض دهنية أقصر

        وظيفة الكوليسترول - يحافظ على سيولة الغشاء

        فيتامينات قابلة للذوبان في الدهون (الدهون) - أ ، د ، هـ ، ك

        ما الذي يحفز أكسدة بيتا للأحماض الدهنية؟ - زيادة تركيز NAD + في مصفوفة الميتوكوندريا

        ماذا يحدث في الشخص السليم الذي يحتوي نظامه الغذائي على القليل جدًا من الكربوهيدرات ومستويات عالية من الدهون؟ - ينتج الأسيتون في الدم

        أحماض أمينية - غير قطبية (كارهة للماء) - قطبية مشحونة - قطبية غير مشحونة

        أي نوع من إصلاح تلف الحمض النووي للثدييات يتطلب وجود كروموسوم مماثل للكروموسوم التالف؟ - إعادة التركيب

        Xeroxerma Pigmentosum (XP) - مرض وراثي متنحي يحدث عندما يكون واحد أو أكثر من الجينات التي تقوم بإجراء إصلاح استئصال النوكليوتيدات غير وظيفية

        لماذا يعاني مرضى XP من الإصابة بسرطان الجلد أعلى بكثير من عامة الناس؟ - تكون الطفرة في جميع الجينات الأخرى أعلى بسبب فشل الإصلاح.

        بافتراض كفاءة التفاعل بنسبة 100٪ ، ما عدد نسخ الحمض النووي التي يتم إنشاؤها بعد إكمال 4 دورات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)؟ - 16

        ما هي وظيفة DNA polymerase في عملية PCR؟ - يتعرف على البادئات ويستخدم dNTPs المتاحة لتكرار تسلسل DNA النموذجي.

        ما الفرق في مناطق جينات SIRT1 و ampamp SIRT2 لدى الأشخاص المدمنين على الكوكايين الذي يزيد من تعبيرهم؟ - تصبح النيوكليوسومات أكثر تباعدًا.

        ماذا يحدث أثناء عملية التضفير البديل لـ RNA؟ - ترتبط مجموعات بديلة من Exons داخل نفس الجين معًا.

        بولي ببتيدات - بروتينات وظيفية

        طفرة هراء - كودون التوقف المبكر مدمج في التسلسل - يقود إلى بروتين أقصر

        الكربوهيدرات - خطي - صيغة CH2O - الطاقة = الجلوكوز - التركيب = السليلوز

        الدهون - - تخزين الطاقة - إشارات - كمية عالية من C

        DNA - - سلم ملتوي - حلزون مزدوج - نواة - ديوكسيريبوز - قواعد = أنين ، ثايمين ، سيتوزين ، غوارين - في جميع الجزيئات - تحتوي على نيوكليوتيدات

        RNA - يلعب & ampquotmessenger & ampquot -in & ampamp خارج النواة -ريبوز -أدينين ، يوراسيل ، غوارين ، سيتوزين -mRNA = رسول (يأخذ رسالة إلى الريبوسوم) -rRNA = RNA الريبوسومي -tRNA = نقل الأحماض الأمينية

        النسخ - يأتي أولاً! ينسخ الحمض النووي إلى رسالة. (RNA polymerase سوف يربط القواعد التكميلية. mRNA يمكن أن يخرج من النواة ليرتبط بريبوسوم الرنا الريباسي)

        كيف يؤدي ارتفاع مستويات ثاني أكسيد الكربون في الدم إلى تعزيز تأكيد الهيموجلوبين غير المؤكسج؟ - يتفاعل ثاني أكسيد الكربون مع H2O في الدم ويقلل من درجة الحموضة ، مما يعزز تأكيد قبة مجموعة الهيم.

        كيف يحافظ الهيموجلوبين على درجة حموضة الدم محايدة أثناء التمرين؟ - الهيموجلوبين غير المؤكسج يرتبط بزيادة H +

        ماذا يحدث في الأنسجة المحيطة مع زيادة كمية الهيموجلوبين المشبع بالأكسجين؟ - ينخفض ​​تركيز أيونات الهيدروجين.

        الترجمة - الخطوة الثانية - تبني البروتين (يترك الحمض النووي الريبي وراءه الحمض الأميني ، وسلسلة مبنية من الأحماض الأمينية)

        العوامل التي تفضل الشكل المؤكسج للهيموجلوبين: - - زيادة الرقم الهيدروجيني - انخفاض ثاني أكسيد الكربون

        ما أيون المعدن المرتبط بحلقة البورفيرين في الهيموجلوبين؟ - حديد

        ما هي ميزة الهيموجلوبين التي تجعله جزيء نقل O2 فعال؟ - تقاربها لـ O2 ينظمها الرقم الهيدروجيني.

        ما هو التعديل المؤقت لهيكل البروتين بواسطة كينازات التي تغير وظيفة الإنزيم؟ - الفسفرة

        ما نوع التثبيط الذي يحدث عندما يرتبط عقار معين بموقع التباين في الإنزيم وبالتالي يغير بنية الإنزيم؟ - غير تنافسي

        البروتياز - فئة من الإنزيمات - تحلل خيوط البروتين إلى وحدات أصغر - زيادة الرقم الهيدروجيني = انخفاض كبير في نشاط البروتياز

        كيف تقارن معدلات التفاعلات المحفزة بالإنزيم بمعدلات التفاعلات غير المحفزة المقابلة؟ - أسرع بمقدار 10 ^ 6 إلى 10 ^ 12 مرة.

        ما التغيير الذي من المرجح أن يزيد من نشاط الإنزيم حاليًا في الظروف المثلى؟ - زيادة تركيزات الركيزة بشكل ملحوظ

        ماذا يحدث فور دخول الجزيء المناسب إلى الموقع النشط للإنزيم؟ - يرتبط الإنزيم بالجزيء ليشكل مركب جزيء إنزيم.

        هل الإنزيمات محددة؟ - نعم

        ما هي العملية التي تتعطل بعد أن يستهلك المريض مضادات حموضة مفرطة تعمل على تحييد درجة الحموضة في المعدة؟ - تقويض البروتين

        في مرضى الزهايمر ، ما الحدث الكيميائي الحيوي المسؤول عن سلوكهم؟ - تجمع البروتين

        في أي حالة قد يؤدي تغيير بنية البروتين إلى حالة مرضية؟ - تحجب طفرة الأكونيتاز خطوة أساسية في التمثيل الغذائي الهوائي

        ما هي القوة الأكثر تأثيرًا في تحديد البنية الثلاثية للبروتين؟ - تأثير مسعور

        الهيكل الرباعي - بنية بروتينية كبيرة وظيفية تتكون أو بروتينات أصغر مع وحدات فرعية متعددة.

        أساسي - مستوى بنية البروتين الذي تم تحديده من خلال تخليق روابط الببتيد بالجفاف

        إصلاح عدم التطابق - - يحدث في أخطاء مع تكرار الحمض النووي - مدقق دنا بوليميريز لمعرفة ما إذا كان الاختيار الصحيح ، لكنه يرتكب خطأ. - إزالة جزء كبير من التلف واستبداله بالكامل

        إعادة التركيب المتماثل - - استخدم النسخة الثانية من الحمض النووي لنسخ المعلومات الصحيحة مرة أخرى

        الانضمام إلى النهاية غير المتماثل - - يحدث قبل تكرار الحمض النووي - تقليم الأطراف - تلتصق معًا مرة أخرى

        PCR - -DNA replication in a test tube -Denature, Anneal, Elongation, Repeat

        Denature - -step 1 of PCR -increase heat to separate the DNA

        Anneal - -step 2 of PCR -use DNA primers that match the gene to find only the gene we want (ex: to find BRCA gene)

        Elongation - -step 3 of PCR -use DNA polymerase to make copies of our genes

        Which ingredients/molecules are required to set up a PCR? - -DNA polymerase (elongation) -DNA nucleotides (dNTPs) -primers (annealing) -template DNA (patient DNA)

        DNA polymerase always makes strands : - 5'-3'

        What breaks ionic bonds? - -pH changes -salt changes

        What breaks hydrogen bonds? - -pH and salt changes (Disulfide bonds broken by reducing agent)

        What breaks hydrophobic bonds? - Heat

        Types of bonds from strongest to weakest - -disulfide bond -ionic bond -hydrogen bond -hydrophobic bond

        Which bond is weakest, but have most influence on protein structure because of how many there are? - Hydrophobic bond

        Quaternary Structure - -only some proteins will get here -2 or more subunits -proteins -Polypeptides (Example= myoglobin and hemoglobin)

        Hydrolysis - Broken peptide bonds

        Chaperones - Help fold proteins

        Denature - -have an environmental change that causes a protein to misfold or unfold. -breaking side change &amp secondary structure bonds -disulfide=reducing agent -ionic=pH or salt change -hydrophobic=heat change

        Degradation - Break peptide bonds (Hydrolysis)

        Aggregation - -proteins clump together in abnormal way (d/t hydrophobic interactions)

        Enzymes - -functional proteins -catalysts -reusable (can be recycled!) -specific -induced fit -work like assembly line (enzyme pathway)

        Feedback inhibition - -stop the enzyme &quotassembly line&quot because we have too much &quotproduct&quot -happens naturally to maintain homeostasis

        Competitive inhibition - -medicine/drugs -competitive inhibitor will bind to active site to prevent substrate from binding -(overcome inhibition by adding more substrate)

        Non-competitive inhibition - -more effective -bind to allosteric site of enzyme -changes the shape of the protein

        DNA - -phosphate + deoxyribose sugar + A/T/C/G -contains 2 strands -the strands are anti-parallel (opposite each other) : 5'-3' 3'-5'

        RNA - -phosphate + ribose sugar + A/U/C/G

        -binds to hgb on the heme &amp blocks O2 from binding -has 200 x higher affinity -a competitive inhibitor -puts hgb into the R state (makes hgb want to bind hgb even more) -this is why it is so dangerous, our hgb picks it up instead of O2)

        2, 3, BPG - -produced in our body naturally -similar function to H+ (stabilizes the T state) -produced in 2 cases (high altitudes &amp pregnancy)

        Hemoglobins role I'm CO poisoning - Hgb binds to CO with a higher affinity than O2 &amp stabilizes the R state

        What facilitates the transition of hgb from the R state to the T state? - An increase in the concentration of H+

        Carbohydrate metabolism - 1. Glycolysis 2. Citric acid cycle (aerobic) 3. Electron transport chain (aerobic) 4. Firmentation (anaerobic) 5. Gluconeogenesis (anaerobic)

        What occurs during aerobic respiration? - NADH &amp FADH2 are produced from NAD &amp FAD during citric acid cycles. -NADH &amp FADH2 donate electrons to the ETC, re-engineering NAD &amp FAD. -O2 accepts electrons, producing water

        What directly provides the energy necessary for the conversion of ADP to ATP by ATP synthase?

        • Protons moving down a concentration gradient from the intermembrane space to the mitochondrial matrix.

        Cori Cycle - -muscle cells produce lactate which is then converted to glucose in the liver

        Exonuclease - During DNA replication, if an error is detected, DNA polymerase removes the nucleotides and replaces them with correct ones.

        Insulin - -increase glucose in blood -fed state(after we eat, increase glucose=pancreas releases insulin)

        -lets glucose into cells -signals for GluT4 to go to cell membrane

        Glycolysis - -break glucose -make ATP (useable energy)

        Glycogenesis - -store glucose as glycogen (short term storage) -in liver

        Fatty acid synthesis - - make fat from acetyl CoA -fats stored in triglycerides (3 fatty acids) -adipose tissue (long term storage)

        Glycogenolysis - Break glucose out of glycogen

        Gluconeogenesis - -make new glucose(from lactate) -acetyl CoA pyruvate glucose -glycerol (from triglycerides) -amino acids(last resort!)

        Beta oxidation - Break fats into acetyl CoA

        Fatty acid structures - -made up of carbonyl groups

        Saturated fatty acids - -no double bonds -maximum Hs

        Unsaturated fatty acid - -(not saturated with Hs) -at least 1 double bond -lose 2 Hs per double bond

        Essential - -we have to eat it (our bodies cannot make it) -omega 3 -omega 6

        Unsaturated fats - -natural (veg oils) -1 double bond

        Trans-unsaturated - -treat saturated with chemicals to switch hydrogen to other side -not natural! Build up in our body d/t doesn't recognize them.

        Fluidity - -more double bonds=always more fluid! -if same # double bonds, but shorter chain, will be MORE fluid!


        Pros And Cons Of Genetic Engineering

        This is the restriction enzyme and acts as “molecular scissors” cuts the two DNA chains at a specific area in the genome so that sections of DNA can be supplemented or detached. A piece of RNA known as guide RNA is the second key molecule. This consists of pre-designed RNA quite small in length sequence, consisting of about 20 bases, positioned within a longer RNA scaffold. The scaffold binds to DNA and the pre-designed sequence ‘guides’ Cas9 to the right part of the genome. ensuring that the Cas9 enzyme intersects at the right point in the genome.


        What is the difference between transcription and translation?

        (Insert diagram of the central dogma DNA -> RNA -> Protein)Transcription is the process of converting DNA to RNA. First, within the نواة, DNA helicase breaks hydrogen bonds between base pairs to unwind the DNA. Then, complimentary free RNA nucleotides bind to exposed bases on the template strand. RNA polymerase then forms the sugar phosphate backbone. Introns and exons are repeatedly transcribed to make pre-mRNA which terminates at the stop codon. The pre-mRNA is then تقسم to remove the introns and form mRNA.Translation follows this by converting RNA to protein. the mRNA leaves the nucleus via a nuclear pore into the السيتوبلازم. أ ribosome binds to the mRNA. الحمض الريبي النووي النقال carrying an amino acid binds its anti- codon to the complimentary codon on the mRNA. A second tRNA binds adjacent to this first codon, carrying another specific amino acid. Peptide bonds form between the amino acids and another specific tRNA- amino acid complex binds adjacently, forming a polypeptide chain. When the ribosome reaches a stop codon on the mRNA, it disengages. this because there are no tRNA anti- codons complimentary to stop codons.


        Markscheme

        gene is a sequence of DNA bases
        DNA/gene codes for a specific sequence of amino acids/polypeptide
        enzymes are proteins/composed of polypetides
        sequence of amino acids determines tertiary structure/folding/shape of active site
        change in the gene/mutation will affect the active site/function of an enzyme
        enzymes are involved in replication/transcription of genes
        enzymes are involved in synthesis of polypeptides

        metabolic pathways can be a sequence/chain of reactions
        they can be cycles of reactions
        different enzymes control each reaction in the sequence/cycle
        accumulation of an end-product can inhibit the first enzyme of the sequence/ pathway
        (an end-product inhibitor) joins an allosteric site/a site separate from active site
        attachment at the allosteric site changes the shape of the active site
        preventing the binding of substrate
        until the level of the end-product is reduced (and the inhibition removed)
        this is an example of negative feedback


        أ. phloem transports organic compounds/sucrose

        ب. from sources/leaves/where produced to sinks/roots/where used

        ج. through sieve tubes/columns of cells with sieve plates/perforated end walls

        د. loading of organic compounds/sucrose into /H + ions out of phloem/sieve tubes by active transport/using ATP

        ه. high solute concentration causes water to enter by osmosis (at source)

        F. high (hydrostatic) pressure causes flow (from source to sink)

        ز. companion cells help with loading / plasmodesmata provide a path between sieve tubes and companion cell

        أ. meiosis / production of male and female gametes

        ب. pollination / transfer of pollen from anther to stigma

        ج. fertilization happens after pollination / fertilisation is joining of gametes

        د. seed dispersal / spread of seeds to new locations

        أ. helicase unwinds the double helix

        ب. gyrase/topoisomerase relieves strains during uncoiling

        ج. helicase separates the two strands of DNA/breaks hydrogen bonds

        Accept unzips here but not for mark point a.

        د. each single strand acts as a template for a new strand / process is semi-conservative

        ه. DNA polymerase III can only add nucleotides to the end of an existing chain/to a primer

        F. (DNA) primase adds RNA primer/short length of RNA nucleotides

        ز. DNA polymerase (III) adds nucleotides in a 5&rsquo to 3&rsquo direction

        ح. complementary base pairing / adenine to thymine and cytosine to guanine

        أنا. DNA polymerase (III) moves towards the replication fork on one strand and away from it on the other strand

        ي. continuous on the leading strand and discontinuous/fragments formed on the lagging strand


        Translation may occur in either the cytoplasm or the rough endoplasmic reticulum. Two molecular factors that play a key role in translation are transfer RNAs.

        QUESTION No 1 How eggs and sperms are produced? Explain in detail the mechanism of fusion of Egg and sperm in human? ANSWER: Gametogenesis is the formation.

        With the developed technology and the phylogenetic tree method, scientists are now able to investigate genes and cells individually to distinguish whether pr.

        Gel electrophoresis is a laboratory method used to separate macromolecules. Also, used in the production of recombinant DNA and DNA cloning restriction fragm.

        Next, short strands of RNA, called the RNA primers, are synthesized by an enzyme called primase. This provides a 3’ OH group for enzyme called DNA polymerase.

        This particular copy is called messenger RNA (mRNA) molecule. What this messenger RNA would do is, it would leave the nucleus because DNA it not allow to lea.

        Our immune system is reliable for killing harmful things that cause diseases. Immune systems with cancer cells are lacking cells with genes and no faults, so.

        بناء الحمض النووي ، والحمض النووي الريبي ، والبروتين عن طريق نماذج البناء مقدمة تصنع الأحماض النووية من النيوكليوتيدات. عندما تشكل هذه الأحماض النووية متواليات فإنها ج.

        A case on cancer cell By Shamik D. Majumdar What does cancer cell mean? Normal cells can repair themselves if any part g.

        β’ jaw, β’ downstream clamp, etc.) that surround the DNA binding channel and stabilize DNA binding interactions. The core enzyme can bind DNA nonspecifically.


        شاهد الفيديو: حلقة 9 من مسائل الـ DNA الهامة - حساب عدد الروابط الهيدروجينية - احياء الصف الثالث الثانوى (شهر نوفمبر 2022).