معلومة

هل تحديد جنس الفطر (عيش الغراب على وجه التحديد) كافٍ؟

هل تحديد جنس الفطر (عيش الغراب على وجه التحديد) كافٍ؟


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

هل يمتلك جنس الفطر معلومات كافية عنه ، بدون الأنواع?

لنفترض أنني أردت التعرف على الفطر (عند قطفه) لمعرفة ما إذا كان بإمكاني انتقاؤه بأمان ثم تناوله لاحقًا. لنفترض أنني نجحت في التعرف على جنس الفطر (باستخدام كتاب دليل رئيسي للتعريف مثل هذا الكتاب). هل هذا كافٍ لتحديد ما إذا كان الفطر صالحًا للأكل أم لا؟ هل يكفي تحديد معلومات عامة أخرى عنها؟ علاوة على ذلك ، هل يكفي تحديد ما إذا كان الطعام جيدًا (كما هو الحال في عدم المرارة)؟ على سبيل المثال ، أعلم أن بعض أنواع الفطر الصالح للأكل تحتوي على أنواع أخرى من الفطر تشبه إلى حد بعيد الفطر غير الصالح للأكل أو الذي يكون مرًا ويصعب طهيه.

بمعنى آخر ، هل هناك أي أنواع من الفطر يُعترف عمومًا بأنها صالحة للأكل ولكنها في الواقع تحتوي على أنواع من الفطر صالحة للأكل وغير صالحة للأكل؟


مرة أخرى ، أود أن أقول: لا ، الجنس لا يكفي.

مثال آخر: boletes (تحديدًا ، جنس بوليتس).

وفقًا لكلية ويلدرنس:

واحدة من أكثر مجموعات الفطر البري الصالحة للأكل شيوعًا وشهرة هي أنواع Boletes أو boletus (Boletaceae) ...

لكن

العديد من الأنواع في هذه المجموعة صالحة للأكل ، مع وجود حفنة منها فقط سامة. أنواع البوليتوس السامة لها مسام حمراء أو برتقالية عميقة. خارج الأنواع السامة القليلة ، بعض أنواع البوليتوس مريرة أو غير صالحة للأكل.

على سبيل المثال ، انظر هنا للحصول على قائمة بفطر البوليطس الصالح للأكل (على سبيل المثال ، B. edulis) ، في حين أن بعض الأمثلة بوليتس تشمل الأنواع التي يجب تجنبها ما يلي: ب.هورونينسيس و الشيطان

هناك مشكلة إضافية لتصنيف جميع الأنواع في الجنس على أنها "آمنة للأكل" ، وهي أن تصنيفاتنا لا تعكس دائمًا حقيقة الجمعيات التصنيفية. بمعنى آخر ، بعض المجموعات ليست أحادية النمط ولا ينبغي افتراض أن خصائصها التطورية (وبالتالي الفسيولوجية / التغذوية) نشأت من نفس السلف المشترك.

هذا صحيح على ما يبدو من boletes. من ويكيبيديا:

تم العثور على Boletus على أنه متعدد الأنواع على نطاق واسع ، مع وجود نسبة صغيرة فقط من أكثر من 300 نوع تم تخصيصها لـ Boletus التي تنتمي بالفعل إلى هناك وتستلزم وصف وقيامة العديد من الأجناس الأخرى

  • انظر على سبيل المثال: Nuhn et al. (2013)1

1: نوهن ، إم إي ، بيندر ، إم ، تايلور ، إيه إف ، هالينج ، ري. and Hibbett، DS، 2013. نظرة عامة على التطور في البوليتينية. بيولوجيا الفطريات ، 117 (7-8) ، ص 479-511.


يبدو أن النسخة البسيطة من سؤالك هي: هل يمكن لأي شخص أن يأتي بمثال واحد لنوعين من الفطريات في نفس الجنس حيث يكون أحدهما صالحًا للأكل والآخر غير صالح للأكل؟

هذا مثال واحد:

الجنس الأمانيت.

يحتوي هذا الجنس على حوالي 600 نوع ويحتوي على بعض جدا الأنواع السامة - في الواقع ، غالبًا ما تُعتبر أحد أكثر أجناس عيش الغراب فتكًا في العالم. السبب؟ يمثل "نوعان" وحدهما الغالبية العظمى من الوفيات المرتبطة بالفطر في جميع أنحاء العالم كل عام: قبعة الموت (A. phalloides) والعديد من الأنواع تسمى كل عامية تدمير الملائكة (على سبيل المثال ، أ. فيروسا, A. bisporigera, أ و أ. فيرنا) في مناطقهم الجغرافية الخاصة.

لكن، أ. قيصرية، المعروف باسم فطر قيصر ، يكون صالحة للأكل على الرغم من كونها في هذا الجنس "القاتل". من ويكيبيديا:

أمانيتا قيصرية ، المعروف باسم فطر قيصر ، هو فطر صالح للأكل يحظى بتقدير كبير في جنس أمانيتا ، موطنه جنوب أوروبا وشمال إفريقيا. يمكن العثور على هذا الفطر أيضًا في لا إسبيرانزا ، هندوراس ، حيث يتم الاحتفال سنويًا بمهرجان على شرفه. في حين تم وصفه لأول مرة من قبل جيوفاني أنطونيو سكوبولي في عام 1772 ، كان هذا الفطر مفضلًا معروفًا للحكام الأوائل للإمبراطورية الرومانية.

انظر هنا لمزيد من المناقشة والتفاصيل.


تحديد الفطر: العلم ليس علمًا دقيقًا

هناك ما هو أكثر من التعرف على الفطر أكثر مما تراه العين أولاً! تم إنشاء هذه الصفحة لتحديد الخطوط العريضة لبعض الأشياء التي يجب البحث عنها عند محاولة التعرف على الفطر البري. قبل الخوض في المزيد من التفاصيل ، يجب أن نتطرق إلى بعض نقاط الأمان المهمة:

  • يمكنك قتل نفسك بأكل الفطر البري. أو على الأقل جرب أكثر كابوس معدي معوي شدة في حياتك. لا تأكل أي شيء لم تحدده بشكل إيجابي ثلاث مرات على الأقل من قبل. لا تأكل أبدًا أي شيء ما لم تكن متأكدًا تمامًا من ماهيته.
  • هناك استثناءات لكل قاعدة. لا توجد قواعد صارمة وسريعة عند تحديد الفطر ، لذلك لا نفترض أبدًا أي شيء. لا تتبع التعميمات مثل & quot؛ الفطر الأبيض آمن للأكل & quot (ليسوا كذلك!). لا تتبع أبدًا خرافات مثل: & quot ؛ ستتحول الملعقة الفضية إلى اللون الأسود إذا حركت الفطر السام أثناء تسخينها على الموقد. وإلا فهم آمنون للأكل & quot. هذه المعتقدات لا يمكن الاعتماد عليها في أحسن الأحوال.
  • هذه الصفحة هي مجرد نظرة عامة على بعض نصائح تحديد الفطر. لا تأكل أي فطر بناءً على شيء تعلمته هنا. إنه ليس دليلاً وليس مفتاحًا دقيقًا. للحصول على أفضل مفتاح لتعريف الفطر على الويب ، راجع صفحة الروابط الخاصة بي.

الآن بعد أن أصبح لدينا الفطرة السليمة بعيدًا عن الطريق ، فلنبدأ مع اللغز المثير المتمثل في تحديد الفطر! هذه الصفحة مقسمة إلى الأقسام التالية:

  • كيف تتعلم - بعض النصائح والحيل حول كيفية البدء.
    - لماذا وكيف تتعلم عن الأنواع السامة المحلية.
    - ما هو الجنس وكيف يرتبط بعملية تحديد الهوية.
    - العوامل الثمانية التي يجب فحصها عند النظر إلى الفطر البري.

يعتبر جمع الفطريات القشرية نشاطًا وحيدًا

خلال يوم مشمس بعد هطول أمطار غزيرة نخرج لجمع الفطر. نخرج من السيارة ويبدأ الجميع بمفردهم أو مع الشركة. تنجذبنا إلى الغابة من خلال درجات الحرارة المنخفضة ، والضوء الخافت الذي يتم ترشيحه بواسطة المظلة وتنوع الفطر على أرضية الغابة. سرعان ما يبدأ كل واحد منا بالتجول لمتابعة جسم فاكهة تلو الآخر ، على أمل العثور على فطريات نادرة أو شائعة في الغابة. بمجرد انتهاء عملية التجميع ، يقوم الجميع بإحضار العينات ووضعها على طاولة. هناك أشعر دائمًا بما أسميه وحدة محبي الفطريات القشرية. معظم أصدقائي وزملائي سيجمعون agarics و boletes و polypores بشكل أقل. عادةً ما أقوم بجمع Agaricomycetes الذي يشبه القشرة وهذا يجعل مجموعاتي أقل جاذبية لمعظم الناس. إن الشعور بجمع هذه الفطريات أمر مجزٍ ، لكن النقص المتكرر في مشاركة الأشخاص في هذه الإثارة أمر محبط.


نظرة عامة على طرق واستراتيجيات تحديد الفطريات

يمكن تصنيف الفطريات التي تظهر في المختبر السريري عمومًا إلى مجموعتين بناءً على مظهر المستعمرات المتكونة. ال الخمائر تنتج مستعمرات رطبة أو كريمية أو غير شفافة أو فطيرة على الوسائط ، في حين أن الفطريات الخيطية أو قوالب (انظر الفصلين 60 و 61) تنتج مستعمرات منفوشة أو قطنية أو صوفية أو مساحيق. تظهر العديد من مسببات الأمراض الفطرية الجهازية إما مرحلة الخميرة (أو الخميرة) ، ويشار إلى الأشكال الخيطية باسم ثنائي الشكل. عندما تعتمد إزدواج الشكل على درجة الحرارة ، يتم تصنيف الفطريات على أنها ثنائي الشكل حراريا. بشكل عام ، تنتج هذه الفطريات شكل العفن عند 25 درجة مئوية إلى 30 درجة مئوية وشكل الخميرة عند 35 درجة إلى 37 درجة مئوية في ظل ظروف معينة.

الفطريات ثنائية الشكل المهمة طبيا هي Histoplasma capsulatum ، Blastomyces dermatitidis ، C. immitis ، Paracoccidioides brasiliensis ، Sporothrix schenckii ، و البنسليوم مارنيفي (انظر الفصل 60). جيم إميتيس ليس ثنائي الشكل حراريا. بالإضافة إلى ذلك ، فإن بعض الخمائر المهمة طبيا ، وخاصة الخمائر الكانديدا الأنواع ، قد تنتج أشكال خمائر ، و / أو خيوط كاذبة ، و / أو خيوط حقيقية (انظر الفصل 62). تسمى الفطريات التي تحتوي على أكثر من شكل مستقل أو مرحلة بوغ في دورة حياتها متعدد الأشكال الفطريات. السمات المتعددة الأشكال لهذه المجموعة من الكائنات الحية لا تعتمد على درجة الحرارة.


اختبار جديد يحدد الفطر السام

ألباني ، كاليفورنيا ، 19 فبراير 2020—اختبار بسيط ومحمول يمكنه اكتشاف أكثر سموم عيش الغراب فتكًا في دقائق تم تطويره بواسطة علماء خدمة البحوث الزراعية (ARS) وزملائهم.

يتسبب تناول الفطر السام في وفاة أكثر من 100 شخص سنويًا على مستوى العالم ، ويترك آلاف الأشخاص في حاجة إلى مساعدة طبية عاجلة. Amanitin هي فئة من سموم عيش الغراب التي تسبب المشاكل الأكثر خطورة.

يمكن للاختبار الجديد تحديد وجود ما لا يزيد عن 10 أجزاء في المليار (ما يعادل 10 سنتات من أصل 10 ملايين دولار) من الأمانيتين في حوالي 10 دقائق من عينة بحجم حبة الأرز من فطر أو في بول شخص أكل الفطر السام المحتوي على الأمانيتين. يعمل الاختبار أيضًا مع بول الكلب ، حيث من المعروف أن الكلاب تتغذى بشكل عشوائي على الفطر.

قال عالم الأحياء الدقيقة في ARS كانديس بيفير ، الذي عمل على التطوير: "لقد طورنا الاختبار في المقام الأول للفطر كمنتجات غذائية. وللمصادفة ، كان حساسًا بدرجة كافية لاكتشاف السم في البول أيضًا". تعمل Bever في وحدة أبحاث الكشف عن السموم المنقولة عن طريق الأغذية والوقاية منها في ألباني ، كاليفورنيا.

لا يوجد حاليًا اختبار تشخيص سريري نهائي في نقطة الرعاية للتسمم بالأماتوكسين. سيساعد الاكتشاف المبكر للأمانيتين في بول المريض الأطباء في محاولة إجراء التشخيص.

وأضافت: "نأمل أن يتمكن الأطباء والأطباء البيطريون من التعرف بسرعة وثقة على التسمم بالأماتوكسين بدلاً من الاضطرار إلى القضاء سريريًا على أمراض الجهاز الهضمي الأخرى المشتبه بها أولاً". "نأمل أيضًا أن يمنح هذا المرضى فرصة أفضل للشفاء ، على الرغم من عدم وجود علاجات فعالة ومحددة بشكل واضح في الوقت الحالي."

يمكن أن يكون الاختبار أيضًا طريقة عملية ونهائية للباحثين عن عيش الغراب لتحديد وتجنب تناول الفطر بسم أمانيتين إذا كان من الممكن العثور على شريك تجاري لإنتاج مجموعة اختبار وتسويقها. هذا الاختبار هو الطريقة الميدانية الأكثر حساسية وموثوقية المتاحة لتحديد الفطر المحتوي على الأمانيتين كيميائيًا. على الرغم من أن خبراء الفطر يمكنهم التعرف على الفطر القاتل بمجرد النظر إلى مظهره ، إلا أن الخبراء لا يستطيعون رؤية المواد الكيميائية السامة الكامنة في الداخل.

لا يزال هذا الاختبار يحدد فقط وجود أو عدم وجود هذه الفئة المحددة من السموم ، ولا يكتشف المركبات الأخرى مثل المهلوسات أو السموم التي تسبب أعراضًا معدية معوية أو عصبية أخرى. لذلك ، لا يمكن تحديد ما إذا كان الفطر صالحًا للأكل.

اكتسب صيد الفطر شعبية في العقود العديدة الماضية. تضم مجموعة تحديد الفطر الواحد على Facebook ، من بين العديد ، أكثر من 166000 عضو. يشتهر البحث عن عيش الغراب في معظم أنحاء أوروبا وأستراليا واليابان وكوريا وأجزاء من الشرق الأوسط وشبه القارة الهندية ، وكذلك في كندا والولايات المتحدة. يعتمد التمييز بين أنواع الفطر غير السامة على تحديد الفطر بشكل صحيح أولاً ثم الرجوع إلى دليل حقل الفطر لتحديد ما إذا كان من المعروف أنه يحتوي على سموم أم لا. لكن عيش الغراب من نفس النوع يمكن أن يختلف في المظهر ، خاصة في مراحل الحياة والموائل المختلفة ، مما يجعل التعرف عليها أمرًا صعبًا للغاية.

تشبه العديد من أنواع الفطر السام الفطر البري الصالح للأكل. على سبيل المثال ، Springtime Amanita (أمانيتا فيلوزا) هو فطر بري صالح للأكل مرغوب فيه للغاية في الولايات المتحدة الساحلية على المحيط الهادئ. ولكن بالنسبة للعين غير المدربة ، يمكن أن تبدو مشابهة لفطر قبعة الموت A. phalloides. يمثل غطاء الموت أكثر من 90 في المائة من وفيات التسمم المرتبطة بالفطريات في أوروبا.

قال بيفير: "يمكن أن يوفر هذا الاختبار مزيدًا من المعلومات حول الفطر البري بما يتجاوز المظهر والخصائص الجسدية ، ويكتشف شيئًا لا يمكننا رؤيته - وهو وجود الأمانيتين". إذا كان منتج مثل هذا متاحًا بأسعار معقولة ، فقد يصبح البحث عن الطعام أكثر شيوعًا وربما أكثر أمانًا.

الاختبار الجديد عبارة عن اختبار مناعي ويعتمد على جسم مضاد أحادي النسيلة تفاعلي بشكل خاص للغاية - وهو بروتين منتَج في المختبر لا يكتشف ويرتبط إلا بهدف محدد. كما ساهم في هذا المشروع علماء من جامعة كاليفورنيا-ديفيس ، ومركز طوارئ الحيوانات الأليفة والتخصصات في مارين ومراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها.


دليل لما يوجد هنا

هذا قسم طويل وقد لا تكون مهتمًا بجميع الموضوعات. لمساعدتك في تحديد ما إذا كان هناك شيء يثير اهتمامك ، إليك وصف موجز للأقسام الفرعية. إذا لم يكن هناك شيء آخر - حاول الميزات العيانية. إذا لم تكن قد نظرت عن كثب إلى الفطريات ، فستظهر لك الصور وحدها مجموعة متنوعة من الميزات التي يمكنك رؤيتها بالعين المجردة أو باستخدام عدسة مكبرة.

  • التصنيف مقابل تحديد الهوية
    شرح الفرق بين التصنيف والتعريف.
  • التسلسل الهرمي للتصنيف
    مخطط موجز للتسلسل الهرمي للتصنيف ، مع ارتباط لمزيد من التفاصيل.
  • التصنيف وتحديد الهوية مرة أخرى
    لماذا لا يتم استخدام الميزات "الواضحة" فقط في تصنيف وتعريف الفطريات؟
  • الميزات العيانية
    روابط لشروحات وتوضيحات للعديد من سمات العين المجردة المستخدمة في دراسة الفطريات. إذا لم يكن هناك شيء آخر ، فقد يجعلك تنظر إلى الفطريات الشائعة من منظور جديد.
  • الهياكل المجهرية
    مقدمة لبعض الخصائص الميكروسكوبية الأساسية المستخدمة في دراسة الفطريات.
  • الميزات غير الهيكلية
    أنت بحاجة إلى أكثر من السمات الهيكلية المجهرية والميكروسكوبية لفهم أعمق للفطريات. فيما يلي بعض الطرق الأخرى التي يمكن أن تلقي الضوء على عالم الفطريات.
  • العلاقات الموجودة وغير الموجودة
    العلاقات ليست دائما واضحة. وهنا بعض الأمثلة.
  • التصنيف والتعريف - الكلمات النهائية
    دراسة حالة موجزة تعيدنا إلى حيث بدأنا.

التصنيف مقابل تحديد الهوية

قبل المضي قدمًا ، يجدر الإشارة إلى الفرق بين التصنيف والتعريف.

التصنيف يجيب على أسئلة من نوع: كيف ترتبط هذه الفطريات بالفطريات الأخرى؟

تحديد الهوية يعالج السؤال الأكثر إلحاحًا: ما اسم العينة الموجودة أمامي؟

إن القول بأن كائنين مترابطين هو نفس القول بأن لهما سلف مشترك - ربما في الماضي القريب إلى حد ما أو ربما في الماضي البعيد. اعتمادًا على ما إذا كان هذا السلف المشترك قد عاش في الماضي القريب أو البعيد ، يمكننا التحدث عن الكائنات الحية على أنها قريبة أو بعيدة. هذا يعكس الفكرة اليومية للعلاقات الإنسانية ، لأننا نقول أن شخصين مرتبطان ارتباطًا وثيقًا إذا كان لديهما نفس الوالدين ولكنهما يتحدثان عنهما كأقارب بعيدين إذا كان الأجداد الأجداد هم أحدث أسلافهم المشتركين.

لذلك فإن التصنيف يتعامل مع التاريخ التطوري ويجب أن يجمع نظام التصنيف الجيد كائنات قريبة تطوريًا قريبة من بعضها البعض. يتطلب هذا فهماً جيداً للعديد من الجوانب المختلفة للبنية الفطرية (العيانية والميكروسكوبية) والبيولوجيا الفطرية ، حيث توفر الجوانب المختلفة أنواعًا مختلفة من الأدلة المتعلقة بالعلاقات. من أجل تطوير تصنيف سليم ، يجب تقييم جميع الأدلة.

في جوهره ، يتضمن التصنيف إنشاء ثقوب الحمام التي سيتم وضع الفطريات ذات الصلة فيها. بمجرد إنشاء فتحات الحمام المختلفة ، يتم إعطاء كل منها اسمًا فريدًا لتمكين التواصل السهل بين أخصائيي الفطريات.

بالاستمرار في تشبيه الحفرة ، فإن تحديد الهوية يشبه التقاط العينة أمامك ووضعها في حفرة الحمام الصحيحة. هناك العديد من أدلة تحديد الفطريات ، وعلى الرغم من اختلافها في النطاق والمحتوى ، إلا أن إجراء التحديد الفعلي هو نفسه إلى حد كبير في كل منها. تُطرح عليك سلسلة من الأسئلة حول ميزات العينة الخاصة بك ، مع كل سؤال متتالي يضيق نطاقًا أكبر قليلاً من فتحات الحمام المحتملة حتى يتبقى لك واحدًا فقط. غالبًا ما تكون عملية ميكانيكية إلى حد ما ولا تحتاج في الغالب إلى أي فهم لتصنيف الفطريات. هذا يعني أنك لا تحتاج في كثير من الأحيان إلى فهم كيفية إنشاء هذه الثقوب. إنه يشبه إلى حد ما الطهي - إذا اتبعت التعليمات الواردة في الوصفة ، فستخبز كعكة لذيذة بنفسك. يجب أن تكون قادرًا على التعرف على أشياء مثل البيض والدقيق والحليب والخميرة ولكنك لست بحاجة إلى معرفة وظيفة أي من هذه المكونات. بالطبع ، يعرف الطباخ الجيد ما تفعله المكونات ويمكنه بعد ذلك بذكاء استبدال المكونات أو تغيير الوصفة لأغراض معينة. وبالمثل ، فإن معرفة تصنيف الفطريات ستمنحك فهمًا أفضل للعالم الفطري ، وتتيح لك اتباع طرق مختصرة ذكية في تحديد الهوية وتساعد على الحماية من سوء الفهم.

التسلسل الهرمي للتصنيف

هناك درجات مختلفة من الترابط في العالم الحي وهذه الدرجات المتفاوتة من الترابط تؤدي إلى مفهوم التسلسل الهرمي لمستويات التصنيف المختلفة - المملكة ، التقسيم (أو phylum) ، الطبقة ، الترتيب ، الأسرة ، الجنس ، الأنواع. هذا التسلسل ينتقل من واسع إلى جيد. أي أن المملكة تحتوي على عدد من الأقسام ، كل قسم يحتوي على عدد من الفئات ، كل فئة تحتوي على عدد من الأوامر وما إلى ذلك.

إذا لم تكن على دراية بالاستخدامات الفنية لأي من المصطلحات المذكورة أعلاه ، فهناك مقدمة مبسطة للمفاهيم الأساسية هنا التصنيف الهرمي وأسماء الأنواع وقسم تحديد الهوية.

اسم النوع هو مزيج فريد من كلمتين لاتينية (أو لاتينية زائفة). هذا المزيج يسمى ذات الحدين. عندما يتم تصنيف الصور الموجودة على هذا الموقع بأسماء الأنواع ، فإن تلك الأسماء (مثل بلدية الفصام في هذه الحالة) & lt & lt042 & gt & gt أمثلة على ذات الحدين. بالعودة إلى تشبيه الحمامي السابق ، يمكننا القول إن أحد ثقوب الحمام لدينا يحمل التسمية بلدية الفصام عليه.

مرة أخرى ، إذا لم تكن معتادًا على بنية الأسماء العلمية ، فسيتم شرح الحقائق الأساسية هنا ، التسلسل الهرمي للتصنيف ، وأسماء الأنواع وقسم تحديد الهوية >>. يحتوي هذا الرابط أيضًا على بعض الأمثلة على التسلسل الهرمي ، من خلال إعطاء المستويات المختلفة لزوجين من الأنواع الفطرية ويحتوي أيضًا على بعض المعلومات حول الموضوعات ذات الصلة.

جميع الفطريات (الكلية) التي هي موضوع هذا الموقع تنتمي إلى مملكة واحدة (تسمى Eumycota) وهناك المزيد من Eumycota أكثر من ذلك ، لكن بقية Eumycota خارج نطاق هذا الموقع.

كما هو مذكور في <> يمكن تقسيم تلك الفطريات (الكبيرة) إلى مجموعتين ، اعتمادًا على ما إذا كانت الجراثيم تنتج في أسكي أو على القاعدة. ضمن التسلسل الهرمي للتصنيف ، تشكل الفطريات التي لديها أسكي قسمًا يسمى Ascomycota وتلك التي تحتوي على basidia تشكل قسمًا يسمى Basidiomycota. من الواضح أن هذين الاسمين الفنيين متشابهين جدًا مع الكلمات الإنجليزية العادية ascomycete و basidiomycete. غالبًا ما يتحدث الناس عن سمات تصنيفية "عالية المستوى" أو "منخفضة المستوى". تُستخدم الأولى في تعريف المجموعات الأعلى مثل التقسيم والفئة بينما تُستخدم الأخيرة في المستويات الأدنى - على سبيل المثال ، لتحديد الأجناس والأنواع. في هذه المصطلحات ، تعتبر أسسي وباسيديا سمات تصنيفية عالية المستوى.

هناك الفطريات القاعدية الدقيقة والفطريات الزائدة ، لكنها خارج نطاق هذا الموقع.

في حين أن الفطريات (الكبيرة) موجودة في قسمين من مملكة Eumycota ، فإن المجموعة الكاملة من الكائنات الحية (الكبيرة والصغيرة) التي من المحتمل أن تسمى "الفطريات" توجد في ثلاث ممالك. ويرد شرح للسمات المستخدمة في التصنيف عالي المستوى لجميع تلك "الفطريات" في <>.

سيكون هناك الآن منعطف قصير حول موضوع التصنيف وتحديد الهوية. بعد ذلك ستكون هناك أمثلة على أنواع الميزات المستخدمة في التصنيف أو التعريف.

التصنيف وتحديد الهوية مرة أخرى


Omphalotus nidiformis (أعلاه) يتوهج في الظلام

Omphalotus nidiformis (اليسار)

يتم أيضًا استخدام العديد من الميزات أو التقنيات المستخدمة في التصنيف بشكل روتيني في تحديد العينات وغالبًا ما يكون ذلك أمرًا لا مفر منه. على سبيل المثال ، اللمعان هو أحد الخصائص المميزة للجنس أمفالوتس، مثال على ذلك معروض في الصور المصاحبة. & lt & lt001، 002 & gt & gt من الواضح أن هذه الميزة التصنيفية التي يمكن ملاحظتها بسهولة هي ميزة تعريف مفيدة للغاية أيضًا.

ومع ذلك ، فإن السمات التصنيفية ليست ضرورية دائمًا في أعمال التعريف اليومية. على سبيل المثال ، يستخدم تحليل الحمض النووي الآن على نطاق واسع للتحقيق في العلاقات بين الكائنات الحية المختلفة. غالبًا ما يكون تحليل الحمض النووي في الأخبار بسبب استخدامه كأداة للطب الشرعي في التحقيقات الجنائية. سيكون هناك المزيد حول تحليل الحمض النووي لاحقًا. يكفي في الوقت الحالي معرفة أن تحليل الحمض النووي هو أداة تصنيف قوية ولكنه يتطلب معدات متخصصة وغير عملي في الكثير من أعمال التعريف الروتينية. لذلك غالبًا ما يستخدم أخصائيو الفطريات الميزات التي يسهل ملاحظتها في كثير من أعمال تحديد الهوية اليومية.

إذا كانت التقنية المتخصصة ضرورية لتصنيف الفطريات ، فكيف يمكنك تجنب استخدامها لتحديد الهوية؟ الشيء المهم هو أنه بينما ستتغير أفكارنا حول كيفية تصنيف الفطريات (والتي ستشمل أحيانًا تغيير الاسم) ، فإن الفطريات نفسها لن تتغير. بعض الفطريات مميزة جدًا ، ولا تشبهها ، بحيث يمكنك دائمًا التعرف عليها من خلال تلك السمات المميزة. بالطبع ، قد يتغير اسم الأنواع التي تقدمها بمرور الوقت & # 150 لكن ميزات التعريف التي تبحث عنها تظل دون تغيير. إنه يشبه إلى حد ما الصديق الذي يتزوج عدة مرات. قد تحتاج إلى شهادات الزواج لإثبات العلاقات المتغيرة & # 150 ولكن هذه الأجزاء من الورق ليست ذات صلة بتحديد الهوية. أنت & # 146ll دائما تتعرف على صديقك بمظهره المميز.

الانواع كالوستوما فيسكوم & lt & lt070 & gt & gt يمكن التعرف عليه فورًا على أساس ميزات العين المجردة. ومع ذلك ، فقد نوقشت علاقاتها بالفطريات الأخرى لفترة طويلة ، حتى بعض دراسات الحمض النووي الحديثة إلى حد ما. هناك & # 146s المزيد حول هذا أدناه في العلاقات الموجودة وغير الموجودة

يسأل الناس أحيانًا: إذا كان بإمكانك تحديد شيء ما باستخدام ميزات يمكن ملاحظتها بسهولة ، فلماذا لا تستخدم هذه الميزات للتصنيف أيضًا وتنسى التقنيات "غير العملية" مثل تحليل الحمض النووي؟ ببساطة لأن الاعتماد على الميزات التي يمكن ملاحظتها بسهولة يمكن أن يؤدي إلى استنتاجات غير صحيحة حول العلاقات. لنأخذ مثالًا إنسانيًا تافهًا ، افترض أن لدينا شقيقين. يقضي أحدهما طوال الصيف في الداخل (ويظل بشرة فاتحة) بينما يكون الآخر على شاطئ أسترالي مشمس كل يوم (ويصبح لونه بنيًا غامقًا). باستخدام ميزة لون الجلد التي يمكن ملاحظتها بسهولة ، يمكن أن يستنتج كائن فضائي يزور الأرض في نهاية الصيف خطأً أن الأخوين لا علاقة لهما. من ناحية أخرى ، كان الفحص الأكثر تفصيلاً قد أظهر للكائن الفضائي أن كلا الأخوين يمكنهما إنتاج أصباغ البشرة الداكنة وأن لون الجلد كان سمة تصنيفية مضللة. كانت البشرة الداكنة على أحد الأخوين مجرد استجابة جسده لبيئة مشمسة.

يعكس التشابه في الحمض النووي التقارب التطوري ، ومن ثم فائدة تحليل الحمض النووي. بالطبع ، يعتمد الشكل الخارجي للكائن الحي اعتمادًا كبيرًا على الحمض النووي الخاص به ، ولكن ، كما يوضح مثال الجلد المدبوغ ، قد لا تكون بعض جوانب الشكل الخارجي أكثر من استجابات للبيئة المحيطة ، بدلاً من كونها سمات متأصلة في الكائن الحي. يجب ألا يستخدم مخطط التصنيف ميزات يمكن تعديلها بسهولة بواسطة البيئة المحيطة. أظهرت التجربة أن بعض السمات الخارجية ، التي كان يُعتمد عليها بشدة في تصنيف الفطريات ، مضللة مثل الجلد المدبوغ في المثال أعلاه.

بالمناسبة ، لا تعتقد أن اللون غير مهم في تصنيف الفطريات (أو تحديدها). غالبًا ما تكون ميزة مهمة - ولكن ليس دائمًا. كما في مثال الأخوين ، من المهم معرفة السبب وراء الألوان. كل من الصور التالية توضح الأنواع فلوتيبس فلامولينا. في البرية ، يحتوي هذا الفطر على غطاء برتقالي لزج قليلاً. يظهر الشكل الأبيض عندما ينمو في الظلام ، في جو به نسبة عالية من ثاني أكسيد الكربون ومع نمو مجموعات الفطر التي تضطر للنمو من خلال أنابيب طويلة. يمكنك أن ترى هذا الشكل المزروع في العديد من محلات السوبر ماركت أو محلات البقالة الآسيوية ، حيث يباع تحت الاسم enokitake.

احصل على صور FLAMMULINA VELUTIPES

  • الميزات العيانية
    روابط لشروحات وتوضيحات للعديد من سمات العين المجردة المستخدمة في دراسة الفطريات. إذا لم يكن هناك شيء آخر ، فقد يجعلك تنظر إلى الفطريات الشائعة من منظور جديد.
  • الهياكل المجهرية
    مقدمة لبعض الخصائص الميكروسكوبية الأساسية المستخدمة في دراسة الفطريات.
  • الميزات غير الهيكلية
    أنت بحاجة إلى أكثر من السمات الهيكلية المجهرية والميكروسكوبية لفهم أعمق للفطريات. فيما يلي بعض الطرق الأخرى التي يمكن أن تلقي الضوء على عالم الفطريات.
  • العلاقات الموجودة وغير الموجودة
    العلاقات ليست دائما واضحة. وهنا بعض الأمثلة.

التصنيف والتعريف - الكلمات النهائية

أعطاك هذا القسم جولة سريعة في بعض أدوات تصنيف الفطريات وأشار إلى بعض العلاقات غير البديهية بين الفطريات المختلفة. على مدى القرون الثلاثة الماضية ، تغير تصنيف الفطريات ، حيث أصبحت السمات المجهرية ذات أهمية كبيرة الآن وهناك سرد موجز لتوقيت بعض الاكتشافات المجهرية الأساسية في <>. توفر جوانب أخرى مختلفة من السلوك الفطري معلومات إضافية. توفر كل أداة استقصائية ، سواء كانت شكل الجسم المثمر ، أو سمات البوغ ، أو اختبارات التزاوج أو تحليل الحمض النووي ، طريقة مختلفة للنظر إلى الفطريات. من أجل التوصل إلى نظام تصنيف قوي ، من الضروري التعامل مع الفطريات بهذه الأدوات المختلفة وتقييم المعلومات التي يوفرها كل منها.

في بعض الأحيان قد تتعارض الأدلة من نهج ما مع الأدلة من نهج آخر. على سبيل المثال ، التصنيف القديم (الاعتماد على "الحبر" كميزة مهمة) وضع كل Inkcaps في الجنس كوبرينوس - لكن تحليل الحمض النووي يقول إن Inkcaps لا تنتمي جميعها إلى جنس واحد - في الواقع ، ولا حتى في عائلة واحدة. ماذا تفعل عندما تحصل على أدلة متضاربة؟ من الواضح ، إعادة التحقق من الأساليب لمعرفة ما إذا كانت هناك أي أخطاء. إذا لم يكن الأمر كذلك ، فيمكنك إما قبول مجموعة واحدة من الأدلة باعتبارها أكثر موثوقية من الأخرى أو ترك المشكلة دون حل. ليست بالضرورة نتيجة سعيدة للغاية ، ولكن في بعض الأحيان يكون من الضروري تنحية المشكلة جانبًا وانتظار التطورات المستقبلية لحل المشكلة.

في حالة كوبرينوس، أعاد الناس تحليل الحمض النووي ، باستخدام تقنيات محسنة ، وما زالوا يتوصلون إلى نفس النتيجة. شيء واحد يجب ملاحظته هو أن دليل الحمض النووي لم يكن مفاجأة كبيرة لبعض علماء الفطريات ، حيث كان هناك جدل كبير (أكثر من مائة عام) حول العلاقات الصحيحة بين كوبرينوس محيط. دفعت نتائج الحمض النووي إلى إعادة فحص الهياكل العيانية والميكروسكوبية في مختلف كوبرينوس محيط.

تشير أدلة الحمض النووي إلى ذلك كوبرينوس غيبوبة وتشكل بعض الأنواع الأخرى مجموعة مرتبطة ارتباطًا وثيقًا ، لذلك هناك حجة جيدة لتجميع تلك الأنواع في جنس خاص بها. بصرف النظر عن دليل الحمض النووي ، فإن الأنواع في هذه المجموعة تشترك في بعض الميزات المجهرية والميكروسكوبية التي لا توجد في غيرها كوبرينوس محيط. من السهل جدًا رؤية ميزة واحدة مجهرية. جذع كوبرينوس غيبوبة يشبه الأنابيب ، وليس صلبًا ، لكن الأنبوب ليس فارغًا. هناك سلك ضعيف ، يتكون من حزمة من الواصلة ، يمتد بطول المركز المجوف وليس له غرض معروف. تُظهر هذه الصورة عينة مجففة من كوبرينوس غيبوبة، مع فتح الجذع للكشف عن الحبل المركزي الضعيف. الحبل موجود في الأنواع الأخرى التي تتجمع معها أدلة الحمض النووي كوبرينوس غيبوبة - ولكن الحبل غائب عن هؤلاء كوبرينوس الأنواع التي لم يتم تجميعها معها كوبرينوس غيبوبة.

من المثير للاهتمام أن نلاحظ ذلك في لوحة من كوبرينوس غيبوبةنُشر عام 1781 في كتاب لعالم الطبيعة الفرنسي جان بابتيست فرانسوا بيير بوليارد (1752-1793) ، أظهر هذا الحبل بوضوح شديد. ومع ذلك ، كان يُعتقد أن الحبر سمة مهمة ولذلك تم استخدامه في التعريف الأصلي لـ كوبرينوس. إذا (ويجب التأكيد على "إذا") فإن الأنواع الموجودة في كوبرينوس غيبوبة المجموعة مفصولة عن بقية كوبرينوس من الأنواع ووضعها في جنس خاص بها ، سيكون هذا الحبل القوطي ميزة تعريف مفيدة جدًا وسهلة الاستخدام للجنس الجديد. ستظل Inkiness ميزة مفيدة للغاية ، ولكنها ميزة تحتاج إلى زيادة. في حين أن الحبر لم يعد يأخذك إلى جنس واحد فقط ، فإنه سيأخذك إلى مجموعة صغيرة من الأجناس ، وبعد ذلك يمكنك استخدام أدلة إضافية (مثل الحبل النخاعي) لتحديد الجنس.

في الوقت الحاضر ، فإن حالة الأنواع في كوبرينوس قيد المناقشة وهناك حاجة إلى مزيد من العمل قبل تسوية النقاش والاتفاق على أي جنس جديد.

ومع ذلك ، فإن كوبرينوس يُظهر العمل أنه كلما تم استخدام تقنية متخصصة للمساعدة في تصنيف الفطريات ، فمن الضروري إعادة فحص الميزات الأخرى لمعرفة ما إذا كان هناك أي شيء مرتبط بنتائج التقنية المتخصصة. قد لا يحدث هذا دائمًا ، ولكن في المثال الحالي ، فإن الحبل في الجذع المجوف هو سمة يسهل ملاحظتها وترتبط بالأدلة الجينية. لذلك سيكون الحبل مثاليًا لأغراض التعريف ، بافتراض أن كوبرينوس غيبوبة يتم وضع المجموعة في جنسها الخاص.

هذا يعيدنا إلى حيث بدأنا. تذكر أن التصنيف والتعريف شيئان مختلفان. بينما يجب أن يجمع التصنيف العديد من خيوط الأدلة المختلفة (باستخدام مجموعة متنوعة من الأساليب) ، لتحديد الهوية نستخدم أي ميزات تجعل من الأسهل الإجابة على السؤال: "ما اسم العينة الموجودة أمامي؟".


أساليب

سير عمل CCMetagen والتنفيذ

CCMetagen هو سير عمل يتم تنفيذه في Python 3 (Python ≥ 3.6). يتطلب التحليل قاعدة بيانات مرجعية تحتوي فيها رؤوس التسلسل على معرفات تصنيفية (تاكسيات). تتوفر قواعد بيانات مرجعية جاهزة للاستخدام (NCBI nt و RefSeq) وإرشادات لإنشاء قواعد بيانات مرجعية مخصصة في موقع CCMetagen على الويب: https://github.com/vrmarcelino/CCMetagen [21]. يتم أولاً تعيين قراءات التسلسل أو contigs أو القراءات الطويلة إلى قاعدة البيانات المرجعية باستخدام KMA [16] ، والتي تقبل التنسيقات أحادية الطرف أو ذات النهاية المزدوجة ، fastA ، fastQ ، والمضغوطة (gzip). ثم يتم استخدام CCMetagen لمعالجة نتائج KMA عبر برنامجين رئيسيين: CCMetagen.py و CCMetagen_merge.py. يأخذ الأمر الأول نتائج KMA كمدخلات ويقوم بإجراء مراقبة جودة مخصصة حيث يمكن للمستخدم تحديد الحد الأدنى من المتطلبات لقبول التطابق من حيث عمق التسلسل والتغطية ودرجات ConClave. سيكتشف خط الأنابيب سلالتين (أو أكثر) وثيقتي الصلة إذا كانت هناك اختلافات SNP يمكن اكتشافها بين محاذاة الإجماع (بين تسلسل الاستعلام والقوالب). لنفترض أن الشكل 1 ب (الخطوة 1) يشير إلى نوعين مرتبطين ارتباطًا وثيقًا بكميات مختلفة ، فإن خط الأنابيب لن يكتشفهما على أنهما أصناف منفصلة ، حيث لا توجد اختلافات يمكن اكتشافها بينهما.

ال CCMetagen.py يقوم البرنامج بعد ذلك بمعالجة المعلومات التصنيفية باستخدام مجموعة أدوات ETE [55] ويخرج جدول تصنيف مُصنّفًا - حيث تُنسب الأسماء المصنفة للمملكة الفائقة ، والمملكة ، واللجوء ، والفئة ، والترتيب ، والعائلة ، والجنس ، والأنواع عند معرفتها. يتم حساب تشابه تسلسل محاذاة الإجماع بين تسلسل الاستعلام والقالب باستخدام KMA. CCMetagen.py يطبق عتبة تشابه التسلسل لتحديد أدنى مرتبة تصنيفية يمكن أن تُعزى بثقة. تستند العتبات الافتراضية إلى تحليلات واسعة النطاق للتسلسلات الفطرية [49 ، 50] ويمكن تغييرها أو تعطيلها (بحيث لا يتم إجراء ترشيح تشابه) باستخدام الخيارات المضمنة في CCMetagen.py. يوفر البرنامج خيار تحويل وحدات الوفرة إلى القراءات الشائعة الاستخدام لكل مليون (RPM) ، ولإنتاج رسوم بيانية تفاعلية توضح الوفرة النسبية للأصناف باستخدام الكرونا [17]. بعد معالجة العينات الفردية مع CCMetagen.py, the user can use CCMetagen_merge.py to produce a single spreadsheet containing the results of all samples in comma-separated values (CSV) format. This spreadsheet reassembles an operational taxonomic unit (OTU) table, helping to integrate the CCMetagen results with existing statistical software designed for microbiome analysis (e.g., PhyloSeq [19]). CCMetagen_merge.py provides the option to merge taxa at different taxon ranks and to include or exclude taxa. A step-by-step tutorial on the CCMetagen workflow is provided online (https://github.com/vrmarcelino/CCMetagen/tree/master/tutorial [48]), and a web server version of CCMetagen, which requires no command line knowledge from the user, is available at https://cge.cbs.dtu.dk/services/ccmetagen/ [23].

Test data sets

A fungal metagenome and a metatranscriptome were simulated in silico to assess the performance of CCMetagen and other classification pipelines in identifying the fungal members of a microbial community (Additional file 7). Simulations were based on complete fungal genomes obtained from the NCBI RefSeq collection [56]. The metagenome contained 30 fungal species and was simulated with Grinder [57] using parameters to mimic the insert size and sequencing errors of an Illumina library (-md poly4 3e-3 3.3e-8 -insert_dist 500 normal 50 -fq 1 -ql 30 10). Coverage was set to vary between 0.001× and 10× for different species. The simulated metagenome contained 6,767,167 PE reads (6,695,384 PE reads after quality control, see Additional file 3).

The metatranscriptome contained 15 fungal species and was simulated for a subsample of 4000 genes (CDSs) from each fungal genome. Transcripts were simulated with Polyester [58], using the Illumina5 error model and gene expression following a normal distribution of average 3× (20% of genes up- and 20% downregulated). The simulated fungal metatranscriptome contained 9,009,121 PE reads (9,008,363 PE reads after quality control, see Additional file 3).

Additionally, 10 bacterial metagenomes simulated by Segata et al. [32], and compiled in McIntyre et al. [33], were used to assess the performance of the different classifiers in identifying prokaryotic communities with various levels of complexity. Each metagenome contained between 25 and 100 bacterial species [33].

Reference databases

Reference databases were downloaded and indexed as described in Additional file 3. We used three reference databases: (i) “nt”—the NCBI nucleotide collection [20] (ii) “RefSeq-bf,” containing curated genomes of fungi (all assembly levels) and bacteria (only complete) in the NCBI Reference Sequence Database [56] and (iii) “RefSeq-f-partial,” which is a subset of RefSeq-bf, containing only part of the fungal species in our test data sets. The RefSeq-f-partial database was built to assess how the programs perform when reference databases are incomplete, for example, when dealing with species without reference genomes. Fifteen species were removed, resulting in a database that contained 15 of the 30 species in the fungal metagenome sample, and 7 of the 15 species in the metatranscriptome sample (species removed from this data set are listed in Additional file 8). The nt and RefSeq-bf databases indexed to function with KMA and CCMetagen are hosted in two sites, at https://doi.org/10.25910/5cc7cd40fca8e [59] (Australia) and http://www.cbs.dtu.dk/public/CGE/databases/CCMetagen/ [60] (Denmark).

Benchmarking

Details about the quality control and data analyses are described in Additional file 3. Metagenome classifications using Kraken2 v.2.0.6-beta, KrakenUniq v.0.5.6, and Centrifuge v.1.0.3-beta were performed using default values. The performance of the classifiers was assessed in terms of precision, recall, F1 score, and CPU time. Precision was calculated with the formula:


Rapid Species Identification of Cooked Poisonous Mushrooms by Using Real-Time PCR

تين. 1. Electrophoretic analysis of extracted DNA. Samples were electrophoresed on 2.0% agarose gels and stained with ethidium bromide. Panels A, B, and C correspond to DNA purified from the fruiting bodies of O. japonicus, E. rhodopolius، و T. ustale، على التوالى. In each panel, lanes and samples are lane 1, fresh lane 2, baked for 4 min lane 3, stir-fried for 2 min lane 4, tempura-style (deep-fried in tempura batter for 2 min) lanes 5 to 8, boiled for 30, 60, 120, or 180 min, respectively. The size markers are EcoRI/HindIII double digests of lambda DNA and 100-bp ladders. تين. 2. Fluorescence intensity profile during real-time PCR with species-specific primer pairs using genomic DNAs from cooked and uncooked mushrooms as templates. (A) Amplified with OJSP-F/OJSP-R using genomic DNA of O. japonicus. (B) Amplified with ERSP-F/ERSP-R using genomic DNA of E. rhodopolius. (C) Amplified with CASP-F/CASP-R using genomic DNA of T. ustale. Blank, no genomic DNA Fresh, genomic DNA from fresh fruiting body Baked, baked for 4 min Stir-fried, stir-fried for 2 min Tempura, deep-fried in tempura batter for 2 min.

Mushroom Toxins

The vast majority of mushroom poisoning are not serious. Gastrointestinal symptoms shortly after ingestion of the mushroom are the most common symptoms. These may be quite severe and may cause great discomfort for a day or two, but they will usually pass on their own. In extreme cases, hospitalization may be necessary to combat dehydration. If symptoms occur within two hours following ingestion of the mushroom, it is a good sign because the most dangerous mushroom toxins rarely cause symptoms before six hours after ingestion.

Each of the major mushroom toxins is discussed individually below. Poisindex numbers are listed, followed by the usual symptoms and treatment, if known. Poisindex refers to the Poisindex system widely used by hospitals and poisoning centers. This classification may mean nothing to you but will be of help to a poisoning center or physician.

The usual symptoms are listed next, followed by treatment, if known. It is not within the scope of this publication to prescribe treatment. When treatments are known, they will be listed, but in all cases a medical doctor should be consulted. Many treatments are not available outside of a hospital, and self-treatment can be more dangerous than no treatment at all. Further details about the poisoning follow, as well as the identifying features of the mushrooms and other useful information. Finally, look-alikes are discussed. If you are collecting mushrooms for food, make certain that you have not collected a poisonous species that resembles the mushroom you want.


Mushroom lights up the night in Brazil: Researcher finds bioluminescent fungus not seen since 1840

In 1840, renowned English botanist George Gardner reported a strange sight from the streets of Vila de Natividade in Brazil: A group of boys playing with a glowing object that turned out to be a luminescent mushroom. They called it "flor-de-coco," and showed Gardner where it grew on decaying fronds at the base of a dwarf palm. Gardner sent the mushroom to the Kew Herbarium in England where it was described and named Agaricus gardneri in honor of its discoverer. The species was not seen again until 2009.

San Francisco State University researcher Dennis Desjardin and colleagues have now collected new specimens of this forgotten mushroom and reclassified it as, Neonothopanus gardneri. Findings are now online and scheduled to be published in the November/December print issue of Mycologia.

They hope that careful study of the Brazilian mushroom -- which shines brightly enough to read by--and its other bioluminescent cousins around the world will help answer the question of how and why some fungi glow.

Desjardin, a professor in ecology and evolution in the SF State Biology Department and his colleagues determined that the mushroom should be placed in the genus Neonothopanus after carefully examining the mushroom's anatomy, physiology and genetic pedigree. But capturing new specimens of the mushroom to examine was a difficult task, Desjardin said, requiring a different approach than most fungi hunting.

To catch the green glow of the bioluminescent mushroom, Desjardin and his long-time research partner in Brazil, Dr. Cassius Stevani, had to "go out on new moon nights and stumble around in the forest, running into trees," he recalled, wary of nearby poisonous snakes and prowling jaguars.

But he said advances such as digital cameras have made it easier to track down bioluminescent fungi. New cameras allow researchers to photograph mushrooms that they suspect might be bioluminescent in darkened rooms and analyze the photos for a glow (sometimes one that's not visible to the human eye) within a few minutes, compared to the 30 to 40 minutes required of regular film exposure.

Bioluminescence -- simply the ability of organisms to produce light on their own -- is a widespread phenomenon. Jellyfish and fireflies might be the most familiar bioluminescent creatures, but organisms from bacteria to fungi to insects and fish make their own glow through a variety of chemical processes.

Bioluminescent fungi have been well-known for centuries, from the bright orange and poisonous jack o' lantern mushrooms to the phenomenon known as "foxfire," where the nutrient-sipping threads of the honey mushroom give off a faint but eerie glow in rotten logs. Glowing fungi have captured the imagination of cultures around the world, Desjardin said. "People are mostly afraid of them, calling them 'ghost mushrooms.'"

But how does a fungus make its glow -- and why would it glow in the first place? It's a question that has fascinated Desjardin for some time.

Researchers believe that the fungi make light in the same way that a firefly does, through a chemical mix of a luciferin compound and a luciferase. Luciferase is an enzyme that aids the interaction among luciferin, oxygen and water to produce a new compound that emits light.

But scientists haven't yet identified the luciferin and luciferase in fungi. "They glow 24 hours a day, as long as water and oxygen are available," Desjardin explained. "But animals only produce this light in spurts. This tells us that the chemical that is acted upon by the enzyme in mushrooms has to be readily available and abundant."

The why behind the glow also remains mostly a mystery. In mushrooms where the spore-bearing part glows, some scientists think the light may help attract insects that can help disperse the spores to grow new mushrooms.

But in the case of foxfire, it's the threadlike mycelium, which seek out nutrients for the fungi, that do the glowing. Insects attracted to the mycelium might do more harm than good to the fungi if they ate the attractively lit structures.

"We have no idea yet why this happens," Desjardin admitted. "Maybe the mycelium is glowing to attract the enemy of these insects, and will eat them before they can eat the mycelium. But we don't have any data to support this."

Desjardin has collected and analyzed bioluminescent fungi from around the world, hoping to answer some of these questions. "We want to know how this happens, how it evolved, and if it evolved multiple times. Each one of these is a fascinating question that we are close to answering."


شاهد الفيديو: أنواع المشرومعش الغراب وطرق تنظيفه وحفظه وإستخدامه - الشيف أسامة - (ديسمبر 2022).