معلومة

تفسير نتيجة التنبؤ mFOLD

تفسير نتيجة التنبؤ mFOLD


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

أحاول أن أتنبأ بالبنية الثانوية لبعض ما قبل miRNAs المتوقعة من خلال mFOLD وهي التقنية المقبولة عمومًا للتنبؤ بالهيكل في معظم الدراسات. أجد صعوبة في تفسير النتيجة وقبول ما إذا كان من الممكن قبول pre-miRNA الذي اخترته و miRNA الذي أملكه وإدراجه في النتيجة.

هذا هو هيكل متنبأ به قبل ميرنا مع عرض موضع ميرنا المتوقع باللون الأخضر.

هل هذا هيكل جيد / سيئ ، وإذا كان الأمر كذلك ، فهل يمكن لأي شخص أن يعطيني سببًا لذلك. شكرا لك.

تحرير: أفهم أن مستويات الطاقة هي أيضًا شيء يتم البحث عنه في التنبؤ. في هذا الشكل المحدد ، ΔG = -75.00 كيلو كالوري / مول والذي أعتقد أنه جيد.

التسلسل المستخدم للطي هو

AAAAATAAAAAACAGAACCATGAGGCAGCGCACCAAGAGCGTCGTGAACGTCCGCGAATA CTTCCGCATGGACGGCAGTGGCGCCCCCGAGCAGGAGGACGACGATGACAACGATGACTG GATGGCCATCGCCATGCAGGGCGCACCGCGTAAGGTCAGCGTGGAAGTCGTTAAGCCTGG CAAGAAGGCACGCGCTCGTACGTCGACGTGTGACTCAC

ومنطقة المباراة المميزة هي

أكجاتجاكاكجاتجاك

لذلك يجب أن يكون هذا الهيكل جيدًا لأن التسلسل يقع على طول بنية الحلقة الجذعية.

أنا قلق بشأن هذا الانتفاخ في الزاوية العلوية اليسرى رغم ذلك. هذا لا يؤثر على إمكانية التنبؤ بهذا الهيكل ، أليس كذلك؟


من المؤكد أن المنطقة الخضراء لن تصنع ميرنا: إنها ليست جزءًا من حلقة جذعية. انظر هياكل ميرنا النموذجية من miRbase.

تعديل

يمكن أن تحدد الانتفاخات أحيانًا الخيط الذي يتم اختياره باعتباره ميرنا ناضجًا. ومع ذلك ، من غير المحتمل أيضًا أن تشكل هذه المنطقة الخضراء ميرنا لأن الجذع يبلغ 15 نقطة أساس فقط.


شاهد الفيديو: استخدام نماذج ARIMA في التنبؤ الاقتصادي مع التطبيق في Eviews (شهر نوفمبر 2022).