We are searching data for your request:
Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Upon completion, a link will appear to access the found materials.
مثال على اسم contig تم إنشاؤه بواسطة المجمع المخملي:
NODE_127_length_39203_cov_244.873016ماذا فعلتcov_244.873016يقصد؟
هذا يبدو وكأنهتغطية. هل تعنييقرأ التغطيةأو وصف إحصائي آخر للكونتيج؟
هذا يعني تغطية k-mer. من دليل المخمل:
4.2.1 ملف contigs.fa
يحتوي ملف fasta هذا على تسلسل contigs أطول من 2 k ، حيث k هو طول الكلمة المستخدم في velveth. إذا كنت قد حددت ملف min_contig_length العتبة ، ثم يتم حذف contigs الأقصر من تلك القيمة. لاحظ أنه ينبغي بالتالي فهم معلومات الطول والتغطية المقدمة في رأس كل كونتيج في k-mers وفي تغطية k-mer (راجع 5.2) على التوالي. على سبيل المثال بالنسبة إلى كونتيج 500 نقطة أساس وطول ك مير 21 ، سيكون الطول في الرأس 480.
