معلومة

CDK3 1 طفرة ترميز بسيطة / طفرات خطأ (S106N) ورم دبقي

CDK3 1 طفرة ترميز بسيطة / طفرات خطأ (S106N) ورم دبقي


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

لقد وجدت الاقتباس أدناه في (Peyressatre ، 2015)

CDK3 1 طفرة ترميز بسيطة / طفرات خطأ (S106N) ورم دبقي
[135]

وقد استشهد المؤلف بقاعدة بيانات وليس ورقة. أريد أن أجد الورقة التي تتحدث عن نوع الطفرة المذكورة أعلاه في CDK3


سؤال جيد ، إذا قمت بفحص COSMIC وبحثت عن S106N ، فلن تجد أي نتيجة مع CDK3. إذن لم يعد موجودًا (بعد الآن؟). أحد الاحتمالات هو أنه كان موجودًا في عام 2014 ، عندما تمت كتابة الورقة ، وتمت إزالة الطفرة في الوقت نفسه عن طريق المعالجة.

ومع ذلك ، إذا نظرت إلى بطاقات الجينات وبحثت عن المتغيرات ، ستجد في أعلى الجدول رابطًا إلى expasy. هنا يستشهدون بورقة في الطبيعة ، وفي البيانات التكميلية لهذه الورقة ستجد طفرة CDK3 S106N الخاصة بك.


UniProtKB: كيناز 3 المعتمد على Cyclin (CDK3): الانسان العاقل: المتغير الطبيعي: 106 S إلى N في عينة ورم أرومي دبقي متعدد الأشكال ؛ الطفرة الجسدية: 1 منشور [Greenman et al. (2007) Nature 446: 153-158].


مثال 2

[0057] مركب أكسيد النيتريك العصبي البشري

[0058] موقع خريطة الجينات: 12q24.2q24.31 (OMIM المرجع 163731).

[0059] أحد الجينات "الجينية" المرشحة هو الجين المشفر لأكسيد النيتريك المركب (NOS-1).

[0060] تشكل الإنزيمات المسؤولة عن تخليق أكسيد النيتروجين في الإنسان عائلة بها ثلاثة أشكال إسوية مميزة على الأقل: محفزة ، وبطانية ، وعصبية. يتم ترجمة Neuronal NO synthetase (NOS-1) إلى الكروموسوم البشري 12 ، ويشارك في عمليات بيولوجية متنوعة بما في ذلك النقل العصبي ، وتنظيم توازن سوائل الجسم ، وعلم وظائف الغدد الصم العصبية ، والتحكم في حركة العضلات الملساء ، والوظيفة الجنسية ، وبيولوجيا الخلية الأحادية.

[0061] بورنيت وآخرون. (1992) توطين NO synthase في الخلايا العصبية القضيبية التي تعصب الجسم الكهفي والضفائر العصبية في الطبقة العرضية لشرايين القضيب. لقد أظهروا أن الجرعات الصغيرة من مثبطات NO synthase ألغت الانتصاب الناتج عن الفيزيولوجيا الكهربية مما أدى إلى أن أكسيد النيتريك هو وسيط فسيولوجي لوظيفة الانتصاب.

[0062] خرازيا وآخرون. وجد (1994) أن جميع الخلايا العصبية في المخطط والعديد من القشرة كانت موجبة لتخليق أكسيد النيتريك مما يشير إلى دور NOS في وظائف المخ.

[0063] تحتوي الحيوانات المستنسخة NOS1 (كدنا) على إكسونات طرفية مختلفة مكونة من 5 رؤوس مقسمة إلى إكسون مشترك 2. Xie وآخرون. (1995) أوضح أن exons الفريدة يتم وضعها ضمن 300 نقطة أساس لبعضها البعض ولكن يتم فصلها عن exon 2 بواسطة intron الذي يبلغ طوله 20 كيلو بايت على الأقل. جزيرة CpG تبتلع exon المحطة الطرفية 5-Prime. في المقابل ، يوجد معظم exon المنبع خارج جزيرة CpG هذه. يتضمن exon المنبع تكرار GT ثنائي النوكليوتيد. يخضع التعبير عن هذين exons للتحكم النسخي بواسطة مروجين منفصلين. يتم تصنيع أكسيد النيتريك في العضلات الهيكلية عن طريق الخلايا العصبية من النوع NO synthase ، والتي يتم ترجمتها إلى غمد الليف العضلي للألياف سريعة الارتعاش. تخليق NO في العضلات النشطة يعارض قوة الانقباض. برينمان وآخرون. (1995) أظهر أن أقسام NOS1 مع أغشية العضلات والهيكل العظمي بسبب ارتباط الإنزيم مع dystrophin ، وهو البروتين المتحور في الحثل العضلي Duchenne. يتفاعل مجمع ديستروفين مع مجال N- طرفي لـ NOS1 الذي يحتوي على شكل GLGF. يُظهر كل من البشر المصابين بـ DMD و mdx فقدانًا انتقائيًا لبروتين NOS1 والنشاط التحفيزي من أغشية العضلات. الفئران التي تعاني من نقص NOS1 مقاومة لتلف السكتة الدماغية العصبية بعد ربط الشريان الدماغي الأوسط. نيلسون وآخرون. (1995) أبلغت عن زيادة كبيرة في السلوك العدواني والسلوك الجنسي المفرط وغير اللائق في الفئران "الضربة القاضية" NOS1. أشارت الملاحظات الأولية إلى أن الفئران الذكور (وليس الإناث) التي تعاني من نقص NOS 1 تشارك في سلوك عدواني مزمن.

[0064] ماجي وآخرون. (1996) استخدم PCR لاستنساخ شكل جديد من NOS العصبية من RNA لقضيب الفئران. تم تسمية NOS cDNA هذا بـ PnNOS لـ "الخلايا العصبية القضيبية NOS". كشف التسلسل أن PnNOS (كدنا) كان مطابقًا للجرذ العصبي المخيخي NOS1 باستثناء إدخال 102 نقطة أساس في PnNOS. أظهر تكرار RT-PCR أن PnNOS هو الشكل الوحيد من NOS1 المعبر عنه في قضيب الفئران والإحليل والبروستات والعضلات الهيكلية. قد يكون PnNOS مسؤولاً عن تخليق أكسيد النيتريك أثناء انتصاب القضيب وقد يكون له دور في التحكم في نبرة الإحليل والبروستاتا والمثانة.

[0065] باستخدام التسلسل الجيني المتاح للخلايا العصبية NOS-1 من الممكن تحديد تلك الأجزاء من الجين التي تظهر تنوعًا كافيًا لتغيير الأداء الطبيعي للجين.

[0066] 1.) تسلسل المروج النسخي:

[0067] سوف تسمح طفرات التسلسل في منطقة المحفز للجين NOS1 بتحديد الأفراد مع التحكم في تنظيم النسخ المتغير.

[0068] 2.) متواليات معالجة الحمض النووي الريبي (الربط):

[0069] وصف الطفرات في بنية intron / exon للجين NOS1 للتعرف على الأفراد الذين لديهم أنماط تضفير RNA متغيرة. ينتج عن ذلك بروتينات مبتورة أو متغيرات لصق ذات وظيفة متغيرة.

[0070] 3.) ترجمة Messenger RNA وتتابعات الاستقرار:

[0071] تسلسل وتمييز الطفرات ضمن التسلسلات المتكررة الموجودة في المنطقة غير المترجمة 3 ′ من الجين NOS-1. لقد قام هؤلاء الأفراد بتغيير التحكم الترجمي في الرنا المرسال الخاص بهم.

[0072] 4.) متواليات الحمض النووي المتضمنة في إعادة الترتيب الجيني أو التوسع:

[0073] يسمح وجود تكرار Alu-1 ، المعروف بتسببه في إعادة التركيب ، بالكشف عن إعادة ترتيب الكروموسومات الإجمالية. قد ترتبط التغييرات في التسلسل أو التركيب الجيني جيدًا بالأعراض السريرية أو المرضية.

[0074] سيتم أيضًا إدراج 102-bp في التباين الوظيفي للنشاط الذي يشمل الجهاز البولي التناسلي.

[0076] ستؤدي الطفرات وتعدد الأشكال في تسلسل الترميز (exon) للجين NOS-1 إلى تغييرات على المستوى الهيكلي للبروتين مع تغييرات وظيفية. ستلعب بدائل الأحماض الأمينية ، داخل الخلايا العصبية NOS-1 ، دورًا في العيوب العصبية المرتبطة بالعمر / الدماغ.

[0078] هذه الاختلافات في التركيب الجينومي للجين البشري NOS1 مهمة في التحكم في الدور الفسيولوجي لـ NOS في الحالات الطبيعية أو المرضية في البشر. التغييرات في فسيولوجيا NOS لها مؤشرات صحية مهمة (مثل السكتة الدماغية وأمراض القلب والدورة الدموية وأمراض الجهاز البولي التناسلي والخلل الوظيفي والأعراض النفسية والاضطرابات العضلية الهيكلية).

[0079] بالنظر إلى تقييم التباين الوظيفي في الجينات الأخرى ، فإن تحديد نمط التباين الجيني NOS1 في مجموعة المرضى أو السكان أو الفرد يوفر أداة عملية قوية لتحسين إدارة الرعاية الصحية والتنبؤ بالمخاطر الصحية.


المطالبات

1. طريقة لفحص عينة بيولوجية من شخص ما للمساعدة في التشخيص أو التشخيص أو مراقبة مرض أو حالة طبية أخرى في الموضوع ، تشمل الخطوات التالية:

أ. عزل جزء صغير من الحويصلات من عينة بيولوجية من الموضوع عن طريق ترشيح العينة متبوعًا بتركيز الترشيح الفائق لإنتاج جزء الحويصلات الدقيقة ب. استخلاص الحمض النووي من الكسر وج. الكشف عن وجود أو عدم وجود علامة حيوية في الحمض النووي المستخرج حيث يكون المرقم الحيوي (1) انحرافًا جينيًا مرتبطًا بالتشخيص أو التكهن أو الحالة أو مرحلة المرض أو أي حالة طبية أخرى ، (2) انحراف جيني مرتبط بمرض أو حالة طبية أخرى أو استجابة لعلاج محدد للمرض أو لحالة طبية أخرى ، أو (3) انحراف جيني مرتبط بتحديد خطر إصابة الشخص بمرض أو حالة طبية أخرى ، وحيث يكون الانحراف الجيني في أو يتوافق مع: i. الجين c-myc الثاني. عنصر قابل للنقل ثالثا. عنصر retrotransposon رابعا. جين مرتبط ساتلي مقابل عنصر DNA متكرر vi. الحمض النووي الريبي غير المشفر بخلاف ميرنا أو السابع. جزء من أي مما سبق.

2. الطريقة وفقًا لعنصر الحماية 1 ، حيث يكون الانحراف الجيني في أو يتوافق مع عنصر مختار من المجموعة المكونة من: عنصر قابل للتبديل مدرج في الجدول 4 أو الجدول 5 ، أو جزء منه عنصر ينقل رجعي يكون LINE أو SINE أو HERV ، أو جزء منها ، عنصر retrotransposon هو Line1 (L1) ، ALU ، HERV-H ، HERV-K ، HERV-K6 ، HERV-W أو HERV-C ، أو جزء منه ، جين مرتبط بالقمر الصناعي مدرج في الجدول 6 ، أو جزء منه ، عنصر DNA متكرر مُدرج في الجدول 8 ، أو جزء منه و RNA غير مشفر مُدرج في الجدول 9 (أو جزء منه) ، بخلاف miRNA.

28- طريقة لفحص عينة بيولوجية من شخص ما للمساعدة في التشخيص أو التشخيص أو مراقبة مرض أو حالة طبية أخرى في الموضوع ، تشمل الخطوات التالية:

أ. عزل جزء صغير من الحويصلات من عينة بيولوجية من الموضوع عن طريق ترشيح العينة متبوعًا بتركيز الترشيح الفائق لإنتاج جزء الحويصلات الدقيقة ب. قياس نشاط عديد الببتيد في الكسر وج. تحديد ما إذا كان نشاط عديد الببتيد أعلى أو أقل من النشاط الطبيعي أو المتوسط ​​لعديد الببتيد حيث يرتبط النشاط المرتفع أو المنخفض بالتشخيص أو التكهن أو الحالة أو مرحلة المرض أو أي حالة طبية أخرى.

29. طريقة الحماية 28 ، حيث يكون البولي ببتيد عبارة عن إنزيم.

30. طريقة المطالبة 29 ، حيث يكون الإنزيم هو النسخ العكسي.

31. طريقة عنصر الحماية 30 ، حيث تتضمن الخطوة (ج) تحديد ما إذا كان نشاط النسخ العكسي أعلى من النشاط العادي أو المتوسط ​​للنسخة العكسية.

40. طريقة المطالبة 1 ، حيث يكون الانحراف الجيني هو:

أ. نوع من الحمض النووي ب. مستوى التعبير عن الحمض النووي ج. متغير الحمض النووي أو د. مزيج من أي مما سبق.

41. الطريقة وفقًا لعنصر الحماية 1 ، حيث يكون الحمض النووي هو RNA ويكون الانحراف الوراثي عبارة عن ملف تعريف تعبير.

42. الطريقة وفقًا لعنصر الحماية 1 ، حيث تحتوي القطعة على أكثر من 10 نيوكليوتيدات.

43. الطريقة وفقًا لعنصر الحماية 1 ، حيث تكون العينة البيولوجية عبارة عن سائل جسدي.

44. طريقة المطالبة 43 ، حيث يكون سائل الجسم هو الدم ، أو المصل ، أو البلازما ، أو البول.

45. طريقة الادعاء 1 ، حيث يكون الفاعل أحد الفاعلين البشريين.

46. ​​طريقة الادعاء 1 ، حيث يكون المرض أو أي حالة طبية أخرى هو سرطان الدماغ.

47. طريقة المطالبة 46 ، حيث يكون سرطان الدماغ هو ورم أرومي نخاعي أو ورم أرومي دبقي.

48. طريقة المطالبة 1 ، حيث يكون المرض أو أي حالة طبية أخرى هو الورم الميلاني.

49. الطريقة وفقًا لعنصر الحماية 1 ، حيث تشتمل خطوة اكتشاف وجود أو عدم وجود مرقم حيوي في الحمض النووي المستخلص على تحليل المصفوفة الدقيقة ، أو تفاعل البوليميراز المتسلسل ، أو تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي ، أو التعبير الجيني الرقمي ، أو التسلسل المباشر.

50. الطريقة وفقاً لعنصر الحماية 1 ، تشتمل كذلك على خطوة إثراء جزء الحويصلات الدقيقة للحويصلات الدقيقة الناشئة من نوع خلية معين.

63- طريقة لعلاج شخص مصاب بنوع من السرطان تفرز فيه الخلايا السرطانية الحويصلات الدقيقة ، وهي الطريقة التي تشمل إعطاء المريض كمية فعالة علاجياً من تركيبة تشتمل على:

أ. مثبط لإفراز الحويصلة الدقيقة ب. مثبط لنسخة عكسية ج. محايد الحويصلات الدقيقة الذي يحيد النشاط المؤيد لتطور الورم للحويصلات الدقيقة للورم أو د. أي مزيج من السابق.

64. طريقة الحماية 63 ، حيث يكون مثبط إفراز الحويصلات الصغيرة مثبطًا لـ RAB GTPase.

65. طريقة المطالبة 64 ، حيث في Rab GTPase هي Rab 27a أو Rab 27b أو Rab 35.

66. طريقة الحماية 63 ، حيث يكون مثبط النسخ العكسي هو نظير نيوكليوزيد تم اختياره من المجموعة التي تشتمل على 3′-azido2 ′ ، 3′-dideoxythymidine (AZT) ، 2 ، 3′-dideoxyinosine (ddI) ، 2 ′ ، 3′-didehyro-3′-deoxythymidine (d4T) ، نيفيرابين وإيفافيرينز.

67. طريقة المطالبة 63 ، حيث يكون مثبط النسخ العكسي هو RNAi الذي يستهدف جين النسخ العكسي.

68. طريقة المطالبة 63 ، حيث يكون معادل الحويصلات عاملًا بيولوجيًا يربط الحويصلات الدقيقة ويدمر سلامة الحويصلات الدقيقة.

70. الطريقة وفقًا لعنصر الحماية 28 ، حيث تكون العينة البيولوجية عبارة عن سائل جسدي.

71. طريقة المطالبة 70 ، حيث يكون سائل الجسم هو الدم ، أو المصل ، أو البلازما ، أو البول.

72. طريقة الادعاء 28 ، حيث يكون الفاعل أحد الفاعلين البشريين.

73. طريقة الادعاء 28 ، حيث يكون المرض أو حالة طبية أخرى هو سرطان الدماغ.

74. طريقة المطالبة 28 ، حيث يكون سرطان الدماغ هو ورم أرومي نخاعي أو ورم أرومي دبقي.

75. طريقة المطالبة 28 ، حيث يكون المرض أو أي حالة طبية أخرى هو الورم الميلاني.

76. الطريقة وفقاً لعنصر الحماية 28 ، تشتمل كذلك على خطوة إثراء جزء الحويصلات الدقيقة للحويصلات الدقيقة الناشئة من نوع خلية معين.


شاهد الفيديو: عملية استئصال الورم من الدماغ (كانون الثاني 2023).